6. Génome des trypanosomes
L'organisation du génome des trypanosomes a pu
être étudiée par l'analyse électrophorétique
en champ pulsé (Pulse Field Gel Electrophoresis =PFGE) du
matériel génomique (Sidibé, 1996). Le
matériel génétique des trypanosomes porté par l'ADN
est localisé dans le noyau (ADN nucléaire) et dans le
kinétoplaste (ADN kinétoplastique).
6-1. ADN nucléaire
Les chromosomes observés dans le noyau se
répartissent en 3 catégories selon la taille.
ü Les mini-chromosomes sont les plus nombreux (une
centaine) et leur taille varie de 50 et 250 Kb. Selon Garside et al. (1994)
(in Sidibé, 1996), dans le sous genre
Nannomonas, T. simiae possède les plus petits
mini-chromosomes (50 à 100 Kb), suivi par les types savane et
forêt de T. congolense. Le type kilifi en
possède les plus gros (100 à 250 Kb).
ü Les chromosomes intermédiaires au nombre de 20
à 50 sont de taille comprise entre 250 et 700 Kb.
ü Les gros chromosomes dont la taille est
supérieure à 1000 Kb, sont au nombre de 15 à 20.
Selon Michels et al. (1991) (in
Sidibé, 1996) le génome d'une cellule haploïde des
trypanosomes est de 3,7.107 Pb. Près de 12% des ADN sont
formés de séquences hautement répétées, 20%
de séquences moyennement répétées et enfin 68% de
séquences non répétées.
6-2. ADN kinétoplastique (ADNk)
Le kinétoplaste, partie fortement
dilatée du système mitochondrial, est très riche en ADN
qui se présente sous la forme de 20 à 50 maxicercles et d'une
dizaine de minicercles. Ils sont disposés en longs filaments
enroulés en spirales sur plusieurs rangées, et
représentent deux types d'ADN différents (Itard,
2000).
ü Les minicercles, d'une taille d'environ 1 Kb, sont
formés d'une région conservée de 100 à 150 Pb et
d'une région variable de 850 à 900 Pb. Une séquence de 12
nucléotides présente sur la région conservée est
hautement préservée d'une espèce à l'autre, voire
d'un genre de kinetoplastidae à l'autre. Certains auteurs
(N'Tambi et Englun, 1985 cités par Sidibé, 1996)
ont montré que cette séquence est à l'origine de la
réplication des minicercles et l'ont appelée « la
séquence universelle des minicercles ». Les minicercles sont
néanmoins très variables au sein d'une même espèce
et varient même au sein d'un stock.
ü Les maxicercles, d'une taille en moyenne 20 fois
supérieure à celle des minicercles, mais d'un nombre
réduit (20 à 50), se retrouvent chez tous les trypanosomes de la
section des Salivaria, à l'exception de T.
evansi (Simpson, 1987 in Sidibé, 1996). Ils
sont formés d'une région variable de 3 à 6 Kb et d'une
région conservée de 17 Kb. Cette dernière porte les
gènes codant pour les ARN ribosomiques des mitochondries et les
gènes codant pour certaines protéines impliquées dans les
phénomènes d'oxydation mitochondriale. Les maxicercles sont d'un
intérêt non moins important, car ils peuvent être
utilisés comme outil de diagnostic.
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