Annexes :
Ratios d'expression des gènes contrôlés
par óS identifiés par puces à ADN. (2. WEBER, et al.
2005)
Figure 1. Crible génétique
utilisé pour identifier la dépendance à RpoS de
gènes en fusion avec lacZ. (3. VIJAYAKUMAR, et al, 2004)
Table 1. Gènes régulées
par RpoS identifiés grâce aux fusions lacZ, et leurs
fonction physiologiques. (3. VIJAYAKUMAR, et al, 2004)
Figure 2. Répartition des fonctions
des gènes régulés par RpoS identifiés grâce
aux puces à ADN. (2. WEBER, et al, 2005)
Figure 3. Le cluster
csiD-ygaF-gabDTP, situé à environ
79min sur le chromosome de E. coli. En noir, les gènes
régulés par RpoS dans les trois conditions,
hachurés : les gènes présentant une régulation
par RpoS seulement dans une ou deux conditions. (2. WEBER, et al, 2005)
Figure 4. Régulations de
l'opéron csiD-ygaF-gabDTP. (1. METZNER,
GERMER, HENGGE, 2004)
Figure 5. Fonctions physiologiques des
gènes identifiés par puces à ADN. (2. WEBER, et al,
2005)
Figure 6. Le promoteur PaidB. En
italique et avec astérisques, les nucléotides ciblés pour
la mutagénèse. (5. LACOUR, KOLB, LANDINI, 2003)
Figure 7. Le promoteur osmEP et les mutants
utilisés. (7. CHECROUN, et al, 2004)
Table 2. Mutants RpoS supresseurs obtenus
après criblage. (7. CHECROUN, et al, 2004)
 Figure 8. Organisation en domaines des protéines
ó70 et óS. (A) Organisation générale et indication
des zones soumises à la mutagénèse. (B) Alignement des
domaines 2.4 de ó70 et óS. La région 2.4 de ó70 est
encadrée. (C) Alignement des domaines 4.2 de ó70 et óS, la
région 4.2 de ó70 est encadrée. (7. CHECROUN, et al,
2004)
Figure 9. Effets des mutations de RpoS
affectant Q152 et E155 sur la transcription de promoteurs osmE
sauvages. Mesure des activités â-galactosidase des fusions
effectuées. (7. CHECROUN, et al, 2004)
Figure 10. Quantification de la transcription
de aidB (ration expression/expression du contrôle),
exprimée en pourcentages de l'activité observée avec
Eó70 sauvage. En blanc : PaidB sauvage, en noir,
PaidBC12T. (6. LACOUR, et al. 2004)
L'étude des mécanismes physiologiques et
génétiques de la réponse aux stress chez
les bactéries a de grand intérêts dans les domaines de la
recherche fondamentale, médicale, agro-alimentaire et industrielle. Chez
Escherichia coli, l'eubactérie la plus
étudiée, l'acteur majeur de cette réponse est le
facteur sigma alternatif RpoS (óS), une des sept sous
unité de l'ARN polymérase responsable de la reconnaissance des
promoteurs et de l'initiation de la transcription. Le
régulon RpoS est large et complexe, en partie parcequ'il
recoupe le régulon de ó70, le facteur sigma principal,
responsable de l'entretien cellulaire. Le présent rapport compile des
études visant à caractériser le régulon RpoS, tant
au niveau des gènes qui en font partie qu'au niveau des
mécanismes génétiques et protéiques de la
sélectivité RpoS/ó70.
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