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Aspects génétiques et moléculaires de la réponse générale aux stress chez Escherichia coli : le régulon RpoS

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par Virginie Dufour
Université de Rennes 1 - Master 1 Biologie cellulaire, génétique, microbiologie et physiologie 2006
  

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Conclusion :

Le régulon RpoS, de part son recouvrement partiel avec le régulon ó70, et le fait qu'il comprenne de nombreuses protéines régulatrices, certaines ayant même pour cible des protéines du régulon RpoS, possède une architecture très complexe, et dynamique puisque cette architecture elle-même est soumise à régulation. (2. WEBER, et al, 2005) Le régulon RpoS recoupe également ceux d'autres régulateurs globaux, comme la protéine Lrp, ou CRP-AMPc, lui-même régulateur de RpoS. Ce dynamisme permet un intégration fine des signaux externes et une adaptation précise de la réponse physiologique par une régulation génétique globale. La compréhension accrue de ce mécanisme est importante puisqu'elle permettra de mieux comprendre les états physiologiques des bactéries, pour des applications dans la recherche fondamentale, l'industrie ou encore la médecine. Par exemple, chez E. coli, l'expression de RpoS ne semble pas dépendre d'une perception de signaux de quorum sensing externes (elle ne possède pas de système de quorum sensing mais est capable de percevoir ceux des autres espèces), qu'en est-il chez d'autres espèces ? (8. HENGGE-ARONIS, 2002)

De nombreuses questions restent à élucider : ici il n'a été traité que de E. coli, et des études sont menées sur le genre Salmonella et sur Thermus Aquaticus, mais pour l'instant presque rien n'est connu sur un grand nombre de procaryotes d'intérêt publique.

Bibliographie :

1. MARTIN METZNER, JENS GERMER, REGINE HENGGE.

Multiple stress signal integration in the regulation of the complex sigma-S-dependent csiD-ygaF-gabDTP operon in Escherichia coli.

Molecular Microbiology (2004) 51 (3), 799-811

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2. HARALD WEBER, TINO POLEN, JOHANNA HEUVELING, VOLKER F. WENDISCH, REGINE HENGGE.

Genome-Wide Analysis of the General Stress Response Network in Escherichia coli: óS-Dependent Genes, Promoters, and Sigma Factor Selectivity.

Journal of bacteriology, Mar. 2005, p. 1591-1603 Vol. 187, No. 5

3. SOMALINGA R. V. VIJAYAKUMAR, MARK G. KIRCHHOF, CHERYL L. PATTEN, HERB E. SCHELLHORN.

RpoS-Regulated Genes of Escherichia coli Identified by Random lacZ Fusion Mutagenesis.

Journal of bacteriology, Dec. 2004, p. 8499-8507 Vol. 186, No. 24

4. STEPHAN LACOUR, PAOLO LANDINI.

óS-Dependent Gene Expression at the Onset of Stationary Phase in Escherichia coli : Function of óS-Dependent Genes and Identification of Their Promoter Sequences.

Journal of bacteriology, Nov. 2004, p. 7186-7195 Vol. 186, No. 21

5. STEPHAN LACOUR, ANNIE KOLB, PAOLO LANDINI.

Nucleotides from -16 to -12 Determine Specific Promoter Recognition by Bacterial óS-RNA Polymerase.

The journal of biological chemistry Vol. 278, No. 39, Issue of September 26, pp. 37160-37168, 2003

6. STEPHAN LACOUR, OLIVIER LEROY, ANNIE KOLB, PAOLO LANDINI.

Substitutions in Region 2.4 of ó70 Allow Recognition of the óS-Dependent aidB Promoter.

The journal of biological chemistry Vol. 279, No. 53, Issue of December 31, pp. 55255-55261, 2004

7. CLAIRE CHECROUN, PATRICIA BORDES, OLIVIER LEROY, ANNIE KOLB, CLAUDE GUTIERREZ.

Interactions between the 2.4 and 4.2 regions of óS, the stress-specific ó factor of Escherichia coli, and the -10 and -35 promoter elements.

Nucleic Acids Research, 2004, Vol. 32, No. 1 45-53

8. REGINE HENGGE-ARONIS

Signal Transduction and Regulatory Mechanisms Involved in Control of the óS (RpoS) Subunit of RNA Polymerase.

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9. F. REPOILA, N. MAJDALANI, S. GOTTESMAN.

Small non-coding RNAs, co-ordinators of adaptation processes in Escherichia coli : the RpoS paradigm.

Molecular Microbiology (2003) 48 (4), 855-861

10. MATTHEW HIRSCH, THOMAS ELLIOTT.

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11. RICHARD A. LEASE, DORIE SMITH, KATHLEEN MCDONOUGH, MARLENE BELFORT.

The Small Noncoding DsrA RNA Is an Acid Resistance Regulator in Escherichia coli.

Journal of bacteriology, Sept. 2004, p. 6179-6185 Vol. 186, No. 18

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