2.2 Organisation génomique
Le génome du VIH-1 comporte trois gènes
principaux (gag, pol et env), ainsi que quelques gènes
de régulation de petite taille. [60,62]
Figure 12. Génome du
VIH [62]
De l'extrémité 5' vers l'extrémité
3', on distingue ainsi les gènes gag, pol et
env, codant respectivement pour les protéines internes, les
enzymes virales (protéase, RT et intégrase) et les
glycoprotéines d'enveloppes. Ce qui caractérise le génome
c'est son grand nombre de gènes régulateurs, codant des
protéines qui régulent la réplication virale dans les
cellules infectées où l'on les retrouve. Ces gènes
régulateurs sont responsables de la complexité de l'organisation
génétique des VIH. [60]
3. CYCLE DE REPLICATION DU VIH
Le cycle de réplication du virus peut être
divisé en deux étapes.
La première, qui se termine par l'intégration du
virus dans le génome cellulaire, s'effectue uniquement par les enzymes
virales, sans expression des gènes viraux ni l'intervention de
mécanismes cellulaires. La deuxième, qui comprend la
synthèse de nouveaux virions, est régulée à la fois
par des mécanismes cellulaires et viraux. Chaque étape de la
réplication des VIH peut être la cible d'intervention
thérapeutique. [57]
3.1. Entrée du virus dans la cellule
· Les protéines
virales
Le virus du SIDA utilise pour rentrer dans ses cellules
hôtes les protéines présentes à sa membrane et
à celle de la cellule hôte. La protéine
virale gp 120 possède en effet un domaine de liaison à la
protéine CD 4. Le virus du SIDA est ainsi capable de se fixer
spécifiquement aux lymphocytes T4, qui portent cette protéine
à leur membrane. Cette fixation de gp 120 à CD4 conditionne
l'ensemble des étapes suivantes permettant la pénétration
de la nucléocapside virale dans le lymphocyte.
La fixation de gp 120 à CD 4 permet de démasquer
une autre protéine membranaire virale : gp 41. Celle-ci s'insert alors
dans la membrane du lymphocyte, permettant la fusion des deux membranes, et
ainsi l'entrée du virus dans la cellule.
[57,60,62]
Figure 13. Pénétration
du VIH dans le lymphocyte
· Co-récepteurs du VIH
(Figure 15)
En réalité, le récepteur CD 4 seul est
insuffisant pour une pénétration du VIH dans la cellule. Des
co-récepteurs sont nécessaires. Parmi ceux-ci, on peut citer deux
protéines transmembranaires : CXCR-4 et CCR-5. Ces co-récepteurs
ne sont pas des protéines spécifiques des lymphocytes T4 : de
nombreuses autres cellules les possèdent. Toutes les souches de VIH
n'utilisent pas le même co-récepteur. Il existe aussi d'autres
co-récepteurs possibles...
[60,62,63]
Il est à noter que certaines personnes possédant
un allèle particulier du co-récepteur CCR5
(délétion de 32 paires de bases dans le gène) semblent
résistantes à l'infection par le VIH. Ces individus
représenteraient 1 % de la population.
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