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TLS, une protéine du spliceosome, est impliquée dans le mécanisme d'action de l'acide rétinoà¯que à  travers les régulations post-transcriptionnelle et transcriptionnelle


par Eric Le Corvec
Université Paris 7 - DEA Biologie des cellules sanguines 2002
  

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RXR RAR

DR5

Figure 7. schéma descriptif de la construction utilisée dans le retard sur gel et de la fixation du RANC

Le signal en 1 correspond à la fixation de RAR et RXR sur le DR5. Le complexe observé est ainsi constitué des récepteurs nucléaires et est appelé RANC. Le signal 2 indique que RXR en fait partie. L'intensité et le retard des bandes 3 et 4 indiquent que TLS fait partie du RANC. A partir de 1 ul (bande 4), plus la quantité de TLS est augmentée, plus le complexe semble déstabilisé (bande 5 et 6). La quantité maximale de TLS pour sa participation au RANC est de 1 ul d'extraits protéiques totaux. Au delà de cette confirmation et en moyennant des expériences de contrôles des phénomènes de compétition ou d'allostérie, TLS pourrait interférer avec le complexe, pouvant empêcher RXR de se lier à l'ADN.

En conclusion, ces résultats préliminaires suggèrent fortement que TLS augmenterait la transcription de gènes cibles de l'AR de manière dépendante du ligand dans les cellules myéloïdes et que ceci serait lié à une participation directe de TLS dans le complexe transcriptionnel RANC. Les expériences dans les cellules Cos-6 montrent que cette régulation par TLS et l'AR pourrait être un phenomène général.

Figure 8. Retard sur gel réalisé avec RAR et RXR, en présence ou absence de TLS.

L'effet de la dose de TLS sur le RANC est déterminé.

3. Analyse in vivo de l'activité de TLS et de l'acide rétinoïque sur l'épissage alternatif en 5' de E1A

A la lumière des résultats obtenus, il est clair que TLS agit sur la voie de signalisation aux rétinoïdes au moins par son activité transcriptionnelle.

Etant donné que TLS peut jouer un rôle de facteur d'épissage en favorisant la sélection du site 5' distal d'épissage de l'ARN pré-m du minigène E1A dans les cellules érythroïdes murines IW1-32, nous avons étudié le rôle de TLS sur l'épissage de l'ARN pré-m du minigène E1A dans un modèle hématopoïétique humain, la lignée myéloïde K562.

L'ARN pré-m E1A contient des sites 5' d'épissage qui mènent à la formation de plusieurs isoformes principales d'ARN (dont les 13S, 12S et 9S). Ces isoformes peuvent être mises en évidence et quantifiées par PCR à l'aide d'amorces spécifiquements choisies (Figure 9).

Figure 9. Représentation schématique de l'épissage alternatif des transcrits de E1A. Les isoformes de l'ARN pré-m de E1A et la taille correspondante des produits de RT-PCR sont montrés. Les amorces pour l'analyse en RT-PCR sont indiquées par des flèches.

Afin d'étudier le rôle éventuel de TLS ou de l'AR sur l'épissage en 5' du minigène E1A, nous avons co-transfecté transitoirement les cellules K562 par la lipofectamine avec les plamides d'expression de E1A, de pCS3 (pour uniformiser les quantités de plasmide utilisés), de TLS (les quantités utilisées sont indiquées) et de CMV-luc (pour mesurer l'efficacité de la transfection). Lorsque la luciférase s'exprime, les ARNs sont extraits, puis rétrotranscrits. Puis une PCR est réalisée. La détection des produits de PCR est faite après séparation sur un gel PAGE-urée par autoradiographie (Figure 10). Enfin, l'analyse quantitative des résultats est obtenu par le système Molecular Analyst de Biorad (Figure 11).

Après s'être assuré de l'efficacité de la transfection, il convient d'obtenir les conditions expérimentales adéquates pour s'assurer de la détection de toutes les isoformes. Il s'agit de faire varier soit la quantité de produits de RT utilisé pour la PCR, soit le nombre de cycles de la PCR, soit l'exposition de l'autoradiographie. Chaque expérience est faite en doublet et reproduite pour s'assurer de la reproductibilité des résultats obtenus. L'étude est basée sur le choix du site 5' d'épissage du minigène E1A que l'on déduit de l'expression en pourcentage des isoformes 13S, 12S et 9S. Il est, de plus, impératif de visualiser une bande correspondant à la forme non épissée de E1A pour que les résultats soient interprétables.

En comparant les résultats sans AR (1) aux résultats avec l'AR (2), il est possible d'affirmer, sous réserve de contrôles supplémentaires (entre 40 et 60 % de 9S) qu'il ne semblerait pas que l'AR seul ait un effet significatif sur l'épissage de E1A dans K562.

Par contre, les résultats en présence de TLS sont reproductibles et confirment que dans les cellules K562, la protéine TLS permet un épissage préférentiel de l'isoforme 9S au détriment des isoformes 13S et 12S. Ce phénomène serait augmenté en présence d'AR. Les résultats (3) montrent que TLS seule favorise la formation de l'isoforme 9S (75 % de 9S), alors que lorsque l'AR est utilisé avec TLS, l'isoforme 9S est considérablement augmentée (90 % de 9S).

Ces résultats indiquent que TLS agit sur la sélection du site 5' distal d'épissage, favorisant la formation de l'isoforme 9S du minigène E1A, phénomène accentué par l'AR. Ainsi, ces résultats suggèrent que TLS agit sur l'épissage dans les cellules hématopoïétiques humaines et que l'AR intervient sur l'épissage à travers TLS.

En conclusion, ces résultats montreraient pour la première fois que l'AR serait impliqué directement dans le contrôle post-transcriptionnel à travers la protéine TLS.

Figure 10. L'épissage alternatif in vivo du minigène E1A dans les cellules K562.

L'intensité des bandes correspondant aux différentes isoformes de E1A pour chaque profil est quantifiée par densitométrie. Les résultats sont exprimés en pourcentage des isoformes 13S, 12S et 9S. Les études sont faites en doublets. Le RT- représente le contrôle négatif de la RT, elle a été réalisée sans enryme RT et aucun ADN n'est révélé. Les ARNs extraits et utilisés sont ainsi exempts d'ADN.

Figure 11. Quantification des isoformes des ARN pré-m de E1A par un logiciel Molecular Analyst de Biorad . Le pourcentage des isoformes 13S, 12S et 9S est représenté.

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"Il faudrait pour le bonheur des états que les philosophes fussent roi ou que les rois fussent philosophes"   Platon