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Les méthodes QSAR/QSPR et identification de nouveaux médicaments: SARS_CoV-2


par Assia REGRAGUI
Université Chouaïb Doukkali - Licence Fondamentale en Matière de Chimie 2020
  

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Projet de Fin d'Etudes

Présentée à :

L'Université Chouaïb Doukkali

Faculté Des Sciences

Licence Fondamentale en Matière de Chimie

Spécialité: Chimie Physique

Les méthodes QSAR/QSPR et identification de

nouveaux médicaments: SARS_CoV-2

Par :

Assia REGRAGUI et Ibtissam BENCHIHEB

Sous la direction de :

Pr. Mohammed Salah

Date de soutenance : 25 septembre 2020 à la Faculté Des Sciences d'El Jadida, Université
Chouaib Doukkali

Résumé

Depuis l'antiquité le monde a connu une apparition fréquente de maladies et épidémies par des virus. Plus récemment, le monde a connu une propagation sévère et rapide de l'épidémie causé par le virus SARS-CoV-2 depuis la fin de l'année 2019 jusqu'à maintenant. Cette infection virale a touché et tué un grand nombre de personnes dans monde entier. Tout cela rendre la découverte de nouveaux médicaments pour lutter contre ces maladies et épidémies munie d'une grande importance. Ce présent rapport a un objectif principal qui consiste dans une part à faire une introduction sur la modélisation avec les méthodes QSAR/QSPR et d'une autre part de faire une identification d'approches visant la découverte de nouveaux médicaments, différentes types de médecines et les médicaments qui peuvent prévenir et lutter contre le virus SARS-CoV-2.

Remerciements

Au terme de ce projet de fin d'étude, nous tenons à exprimer nos respects et nos sincère remerciement à Monsieur Mohammed Salah pour nous 'avoir encadré et fait de leurs mieux afin de nous aider.

Nous chers parents, que nul remerciement ne puisse exprimer nos sincères sentiments, Pour leur patience illimitée, leur encouragement contenu, leur aide, en témoignage de notre profond amour et respect pour leurs grands sacrifices.

Nos chers grands parents, pour me assistant.

Nos chers frères pour leur grand amour et leur soutien qu'ils trouvent ici l'expression de notre haute gratitude.

Et à toutes nos familles et à tous ceux que nous aimons.

Assia REGRAGUI et Ibtissam BENCHIHEB

Table des matières

Introduction générale 1

CHAPITRE 1 : Modélisation QSPR/QSAR 2

1. Les méthodes QSAR/QSPR 2

2. Méthodologie générale d'une étude QSAR/QSPR 4

2.1 Les descripteurs moléculaires 4

2.1.1 Définition 4

2.1.2 Types de descripteurs 5

a. Les descripteurs 0D 5

b. Les descripteurs 1D 5

c. Les descripteurs 2D 6

d. Les descripteurs 3D 7

e. Les descripteurs locaux des propriétés surfaciques moléculaires 8

f. Les descripteurs quantiques/électroniques 8

2.2 Méthodes d'analyse de données 8

2.2.1 Méthodes basées sur les descripteurs 9

a. Approches linéaires 9

b. La régression linéaire multiple (MLR) 9

c. La méthode de régression des moindres carrés partiels 10

d. Approches non linéaires 10

e. Réseaux de neurones artificiels 10

f. Arbre de décision 11

2.3 Interprétation et validation d'un modèle QSPR/QSAR 12

2.3.1 Validation interne 12

2.3.2 Validation externe 12

3. Applications 13

4. Conclusion 13

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"Je ne pense pas qu'un écrivain puisse avoir de profondes assises s'il n'a pas ressenti avec amertume les injustices de la société ou il vit"   Thomas Lanier dit Tennessie Williams