Projet de Fin d'Etudes
Présentée à :
L'Université Chouaïb Doukkali
Faculté Des Sciences
Licence Fondamentale en Matière de
Chimie
Spécialité: Chimie Physique
Les méthodes QSAR/QSPR et identification
de
nouveaux médicaments: SARS_CoV-2
Par :
Assia REGRAGUI et Ibtissam BENCHIHEB
Sous la direction de :
Pr. Mohammed Salah
Date de soutenance : 25 septembre 2020 à la
Faculté Des Sciences d'El Jadida, Université Chouaib Doukkali
Résumé
Depuis l'antiquité le monde a connu une apparition
fréquente de maladies et épidémies par des virus. Plus
récemment, le monde a connu une propagation sévère et
rapide de l'épidémie causé par le virus SARS-CoV-2 depuis
la fin de l'année 2019 jusqu'à maintenant. Cette infection virale
a touché et tué un grand nombre de personnes dans monde entier.
Tout cela rendre la découverte de nouveaux médicaments pour
lutter contre ces maladies et épidémies munie d'une grande
importance. Ce présent rapport a un objectif principal qui consiste dans
une part à faire une introduction sur la modélisation avec les
méthodes QSAR/QSPR et d'une autre part de faire une identification
d'approches visant la découverte de nouveaux médicaments,
différentes types de médecines et les médicaments qui
peuvent prévenir et lutter contre le virus SARS-CoV-2.
Remerciements
Au terme de ce projet de fin d'étude, nous tenons à
exprimer nos respects et nos sincère remerciement à
Monsieur Mohammed Salah pour nous 'avoir encadré et
fait de leurs mieux afin de nous aider.
Nous chers parents, que nul remerciement ne puisse exprimer nos
sincères sentiments, Pour leur patience illimitée, leur
encouragement contenu, leur aide, en témoignage de notre profond amour
et respect pour leurs grands sacrifices.
Nos chers grands parents, pour me assistant.
Nos chers frères pour leur grand amour et leur soutien
qu'ils trouvent ici l'expression de notre haute gratitude.
Et à toutes nos familles et à tous ceux que nous
aimons.
Assia REGRAGUI et Ibtissam BENCHIHEB
Table des matières
Introduction générale 1
CHAPITRE 1 : Modélisation QSPR/QSAR 2
1. Les méthodes QSAR/QSPR 2
2. Méthodologie générale d'une
étude QSAR/QSPR 4
2.1 Les descripteurs moléculaires 4
2.1.1 Définition 4
2.1.2 Types de descripteurs 5
a. Les descripteurs 0D 5
b. Les descripteurs 1D 5
c. Les descripteurs 2D 6
d. Les descripteurs 3D 7
e. Les descripteurs locaux des propriétés
surfaciques moléculaires 8
f. Les descripteurs quantiques/électroniques 8
2.2 Méthodes d'analyse de données 8
2.2.1 Méthodes basées sur les descripteurs 9
a. Approches linéaires 9
b. La régression linéaire multiple (MLR) 9
c. La méthode de régression des moindres
carrés partiels 10
d. Approches non linéaires 10
e. Réseaux de neurones artificiels 10
f. Arbre de décision 11
2.3 Interprétation et validation d'un modèle
QSPR/QSAR 12
2.3.1 Validation interne 12
2.3.2 Validation externe 12
3. Applications 13
4. Conclusion 13
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