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Diversité des begomovirus infectant le gombo au Togo


par Ayékitan AKAKPO
Université Joseph Ki-Zerbo - Master 2 en Biotechnologie 2019
  

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Introduction

nombreux pays d'Afrique sahélienne et ses environs, notamment au Burkina Faso (Barro et al., 1994), au Cameroun (Leke et al., 2013), en Côte d'Ivoire (N'Guessan et al., 1992), au Ghana (Swanson et Harrison, 1993), au Mali (Kon et al., 2009), au Niger (Shih et al., 2009), au Nigéria et au Tchad (Swanson et Harrison, 1993) et en Égypte (Bigarré et al., 2001). Mais, force est de constater qu'au Togo, la littérature demeure déficitaire, voire quasi inexistante en informations nécessaires à un contrôle satisfaisant de ces virus. Pourtant, des symptômes de repliements foliaires retardant la croissance et affectant l'appareil végétatif des plants de gombo ont été observés sur toute l'étendue du territoire. Au regard de la situation actuelle du Togo face à cette pathologie dévastatrice, on se pose des questions sur la situation réelle de cette maladie à Begomovirus au Togo : (i) quelle est l'identité moléculaire des Begomovirus qui infectent le gombo au Togo ? (ii) Quels liens existent entre les caractéristiques moléculaires des Begomovirus du Togo et ceux d'Afrique ? D'où l'initiation de cette étude dont l'objectif général est d'évaluer la diversité des Begomovirus infectant le gombo au Togo. Plus spécifiquement cette étude vise à (i) déterminer l'identité moléculaire des principaux Begomovirus infectant le gombo au Togo et (ii) d'établir la taxonomie de ces Begomovirus du Togo.

CHAPITRE I : SYNTHÈSE BIBLIOGRAPHIQUE

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Chapitre I : synthèse bibliographique

Chapitre I: Synthèse bibliographique

I. Généralité sur le gombo

1. Le genre Abelmoschus 1.1. Historique

Les espèces de gombo cultivées et celles sauvages apparentées ont été initialement classées dans le genre Hibiscus, section Abelmoschus par Linné (1737). Medikus (1787) a proposé d'élever cette section au rang d'un genre distinct, mais la référence au genre Hibiscus

est restée jusqu'au milieu du 20e siècle. Il a fallu attendre la réhabilitation du genre Abelmoschus par Hochreutiner (1924) pour que son emploi soit admis dans les flores et la littérature contemporaine. Ce genre se distingue du genre Hibiscus d'après les caractéristiques du calice: calice spatiforme à cinq dents courtes, soudées à la corolle et caduques après la floraison (Terrell et Winters, 1974).

1.2. Données taxonomiques

Le genre Abelmoschus appartient à la famille des Malvacées. Il comprend environ 1500 espèces. C'est une famille très facile à reconnaître par sa fleur qui a un aspect typique dû à ses pétales à préfloraison tordue et aux nombreuses étamines soudées en un tube (Guignard, 1993). Il se distingue par les caractéristiques du calice. Le genre Abelmoschus est constitué d'une série polyploïde dont l'organisation n'est pas aisée à saisir. On peut cependant distinguer trois niveaux de ploïdie. Un premier ensemble d'espèces possède des nombres chromosomiques de bases compris entre 2n=58 et 2n=78 chromosomes. Il s'agit d'Abelmoschus tubernaculatus, Abelmoschus manihot, Abelmoschus moschatus, Hibiscus coccineus, Hibiscus grandiflorus et Abelmoschus ficulneus. Le deuxième niveau comprend les polyploïdes issus directement des génomes de base (2n = 120 à 140) : ce sont Abelmoschus esculentus, Abelmoschus tetraphyllus et Abelmoschus pungens. Le dernier niveau comprend les gombos de type "Guinéen" d'Afrique occidentale à 2n=192 ou 194 chromosomes (Charrier, 1983).

2. Description de l'espèce Abelmoschus esculentus (L.) Moench 2.1. Origine géographique

Le gombo (Abelmoschus esculentus (L). Moench) est une plante cultivée d'origine controversée. En effet, si l'origine du genre Abelmoschus ne souffre d'aucun débat, deux hypothèses s'affrontent quant à l'origine géographique d'Abelmoschus esculentus (L.) Moench

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