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Diversité des begomovirus infectant le gombo au Togo


par Ayékitan AKAKPO
Université Joseph Ki-Zerbo - Master 2 en Biotechnologie 2019
  

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Chapitre III : Résultats et discussion

A

E

C

D

B

F

Figure14: (B) et (D) plants de gombo avec des feuilles déformées (les feuilles présentent des déformations du limbe avec un épaississement des nervures); (C) enroulement des feuilles de gombo sur elles même (repliement des feuilles sur elle-même vers le haut ou vers le bas avec rabougrissement du plant); (A) et (F) feuilles de gombo en formes de cuillères (une forme de repliement des feuilles vers le haut en forme d'une cuillère accompagné parfois de petites déformations du limbe); (E) feuilles

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Chapitre III : Résultats et discussion

de gombo présentant des jaunissements (feuilles présentant de petites tâches chlorotiques (jaune) en mosaïque sur le limbe) . (Photo Akakpo, 2018)

2. Évaluation de la prévalence de la maladie de l'enroulement foliaire du gombo au Togo

L'évaluation de la prévalence de la maladie de l'enroulement foliaire du gombo au Togo a été faite en considérant les 4 zones agro- écologiques du Togo. Pour se faire, un total de 118 échantillons de feuilles de gombo (symptomatiques et asymptomatiques) a été collecté dans 12 localités (Kantindi, Batambouaré, Nanergou, Agbo, Talo, Kolokopé, Anié, Kpété-béna, Otandjobo, Tsévié, Adetikopé, Djagblé) appartenant à ces 4 zones agroécologiques qui sont : la zone littorale, la zone forestière, la savane humide et la savane sèche. La maladie a été identifiée dans toutes les localités. Les analyses statistiques des résultats obtenus après analyses révèlent que la prévalence de cette maladie au Togo varie d'une localité à une autre ainsi que d'une zone agroécologique à une autre. Elle est de l'ordre de 60% dans la zone forestière, 53,33% dans la zone littorale, 50% dans la savane humide et 64,29% dans la savane sèche (tableau VIII). Sur le plan national, la prévalence moyenne de la maladie était de 56,91%.

Tableau VIII: Prévalences de la maladie dans les quatre zones agroécologiques

Zone

agroécologique

Nombre

d'échantillons

PCR (+)

Prévalence (%)

Forêt

20

12

60,00

Littorale

30

16

53,33

Savane humide

40

20

50,00

Savane sèche

28

18

64,29

3. Caractérisation moléculaire des espèces virales associées à la maladie de l'enroulement foliaire du gombo

3.1. Amplification du gène de la protéine capsidiale par la PCR

L'analyse moléculaire a consisté à faire une amplification du gène de la protéine capsidiale (CP), utilisé comme le marqueur de diversité chez les Begomovirus. La Figure 15 illustre les résultats d'amplification du gène de la CP (protéine capsidiale) en utilisant les couples d'amorces VD 360/CD 1266. L'amplification a permis d'obtenir une bande d'environ 906 paires de bases pour les différents échantillons suspectés d'infection à Begomovirus. Ce test a permis de détecter 66 échantillons positifs sur 118 échantillons collectés (tableau IX).

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