Résumé, Abstract
Résumé
La culture du gombo (Abelmoschus esculentus (L.)
Moench, Malvaceae) offre des produits contribuant à l'équilibre
alimentaire, et à la génération de revenus pour de
nombreux producteurs de beaucoup de pays de l'Afrique de l'Ouest et
particulièrement ceux du Togo. Depuis plusieurs années, la
maladie de l'enroulement foliaire du gombo (Okra leaf curl disease,
OLCD) constitue l'une des maladies les plus dommageables dans plusieurs pays de
l'Afrique de l'Ouest. Elle est occasionnée par des virus du genre
Begomovirus (famille des Geminiviridae) et transmise par la mouche
blanche (Bemisia tabaci Genn.) qui constitue le principal vecteur. En
vue de connaître l'identité moléculaire et la
diversité des Begomovirus responsables de cette maladie sur le
gombo au Togo, des travaux de caractérisation moléculaire ont
été effectués sur 118 échantillons de jeunes
feuilles de gombo (symptomatiques et asymptomatiques) collectés dans les
quatre zones agroécologiques du pays (zone littorale, zone
forestière, savane humide et la savane sèche). Les ADNs totaux
ont été extraits selon le protocole Doyle et Doyle modifié
pour l'extraction d'ADN au Cétyl Trimétyl Ammonium Bromide (CTAB)
et le diagnostic moléculaire a été réalisé
par PCR (Polymerase Chain Reaction) en utilisant un couple d'amorces
dégénérées (VD360/CD1266). Un total de 12
échantillons de produits PCR a été séquencé
et des analyses bioinformatiques ont été réalisées.
Il ressort de ces analyses que les isolats du Togo appartiennent à deux
espèces : le Cotton leaf curl Gezira virus (CLCuGeV) avec une
similitude de 88,71 à 96,56% avec CLCuGeV-Burkina Faso (FN554528),
CLCuGeV-Niger (FJ469627) et le Okra yellow crinkle virus (OYCrV) avec
une similitude de 86,52% à 97,70% avec les OYCrV de la Côte
d'Ivoire (KX100572), du Mali (EU024118) et du Cameroun (FM164724). Cette
étude a permis d'identifier les espèces de Begomovirus
infectant le gombo au Togo. Ces virus constituent un véritable
problème non seulement pour la production du gombo, mais aussi celle du
coton (Gossypium sp. L.) au Togo tout comme dans les autres pays
producteurs de l'Afrique de l'Ouest. Au regard des impacts
socio-économiques négatifs que ces virus pourraient causer, la
mise en oeuvre des stratégies de lutte efficaces s'avère
nécessaire.
Mots clés : Begomovirus,
CLCuGeV, OYCrV, PCR, gombo, Togo
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Résumé, Abstract
Abstract
The cultivation of okra (Abelmoschus esculentus (L.)
Moench, Malvaceae) offers products that contribute to a balanced diet and
income generation for many producers in many West African countries,
particularly those from Togo. For many years, Okra Leaf Curl Disease (OLCD) has
been one of the most damaging diseases in several West African countries. It is
caused by viruses of the genus Begomovirus (Geminiviridae family) and
transmitted by the whitefly (Bemisia tabaci Genn.) which is the main
vector. In order to determine the molecular identity and the diversity of
Begomoviruses responsible for this disease on okra in Togo, molecular
characterization works were carried out on 118 samples of young okra leaves
(symptomatic and asymptomatic) collected from the four agro-ecological zones of
the country (littoral zone, forest zone, wet savannah and dry savannah). Total
DNAs were extracted according to the modified Doyle and Doyle protocol for DNA
extraction with Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide (CTAB) and the molecular
diagnosis was carried out by PCR (Polymerase Chain Reaction) using a pair of
degenerate primers (VD360/CD1266). A total of 12 samples of PCR products were
sequenced and bioinformatic analyzes were performed. These analyzes indicate
that the isolates from Togo belong to two species: the Cotton leaf curl Gezira
virus (CLCuGeV) with a similarity of 88.71 to 96.56% with CLCuGeV-Burkina Faso
(FN554528), CLCuGeV -Niger (FJ469627) ) and Okra yellow crinkle virus (OYCrV)
with a similarity of 86.52% to 97.70% with OYCrV from Côte d'Ivoire
(KX100572), Mali (EU024118) and Cameroon (FM164724). This study identified
Begomovirus species infecting okra in Togo. These viruses are a real
problem not only for of okra and cotton (Gossypium sp L.) production
in Togo as in other West African producing countries. In view of the negative
socio-economic impacts that these viruses could cause, the implementation of
effective control strategies is necessary.
Key words: Begomovirus, CLCuGeV, OYCrV,
PCR, okra, Togo
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