II.1.5.4. Diagnostic bactériologique
- Microscopie :
Bâtonnet en virgule (Vibrio comma de Robert koch), fin
et très mobile, à Gram négatif.
- Culture :
Se fait sur milieux usuel, elle peut même s'effectuer
sur milieux alcalins (PH 8,5 à 9,2) et hyper salés à 30%
de NaCl. Cette propriété est mise à profit pour la
préparation des milieux sélectifs et d'enrichissement (repiquage
successifs). Les colonies sont rondes, bleutées, transparentes.
- Biochimie :
Le Vibrio cholerae est aérobie- anaérobie
facultatif, oxydase positive, nitrate positif et indole positif.
- Structure antigénique
Le Vibrio cholerae possède de paroi de nature
lipopolysaccharidique (endotoxine). Au sein de l'espèce Vibrio
cholerae ; on distingue trois sérotypes distincts dits :
INABA, OGAWA et HIKOJIMA, ce qui aide au typage épidémiologique
des souches. L'antigène flagellaire H est commun à tous les
vibrions (Vibrion cholérique et Vibrion non cholérique).Les
toxines et l'enzyme, l'entérotoxine majeure appelée
choléra gène(CT), n'existe que sous seul type antigénique
.Elle donne naissance à des anticorps dont le rôle protecteur
n'est pas clairement établi. La CT est active à des doses
très faibles, <1ug sur l'anse ligaturée de lapin. CT est une
holoprotéine de 84 KDa (unités A1 et A2 +·5 unités
B). CT agit comme la toxine LT de l'Escherichia
coli.(10)
II.2. LES VIRUS
Il est vrai que les virus sont des éléments
réplicatifs plus petits que les bactéries et les plus grands sont
à peine visibles au microscope optique. Leur génome peut
être composé soit de l'ADN, soit d'ARN. Les virus sont fortement
dépendants du métabolisme cellulaire .Dans la cellule qu'ils
infectent, ils répliquent séparément leur génome et
leurs composants protéiques ; ceux-ci seront ensuite
assemblés donnant des milliers des particules en une
génération.
Les virus reconnaitront spécifiquement un ou quelques
types des cellules et sont à cause de cela assez spécifique
d'organisme hôtes.
Il existe plusieurs types de virus dans leur monde, mais nous
nous sommes intéressés par les trois espèces, suite de
leurs spécificités de germes témoins de la pollution de
l'eau : Rota virus ; Poliovirus et le Virus de l'hépatite
A.(26)
II.2.1. Polio virus
Les Poliovirus, agents responsables de la poliomyélite,
appartiennent au genre Entérovirus. A la suite des nombreuses
études dont il fait l'objet depuis les années 1930 et
particulièrement dans les années 1950, le Poliovirus humain est
devenu un modèle de choix pour l'étude de la biologie
moléculaire des virus animaux à
ARN.(20)
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