Surveillance de la résistance aux antibiotiques de "streptococcus pneumoniae " et "haemophilus influenzae "

Promotion 2009

REPUBLIQUE GABONAISE

MINISTERE DE L'EDUCATION NATIONALE DE L'ENSEIGNEMENT SUPERIEUR DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE ET DE L'INNOVATION

UNIVERSITE DES SCIENCES DE LA SANTE

FACULTE DE MEDECINE

Année 2009 Mémo ire n° 259

scIE~TA ET

c

Surveillance de la résistance

aux antibiotiques de

Streptococcus pneumoniae et Haemophilus influenzae

Mémoire pour l'obtention

Du Diplôme d'Etat de Technicien Supérieur de Biologie Médicale

Présenté par

Monsieur ONDENOT Yann Christian

Née le 31 Décembre 1984 à Port-Gentil

Directeur : Pr Ag Angélique NDJOYI MBIGUINO

Rapporteur : Dr Modeste MABIKA MANFOUMBI

ORGANIGRAMME

PERSONNEL

ADMINISTRATIF

DOYEN Pr. Edouard NGOU MILAMA

ASSESSEURS Pr. Jean-Baptiste MOUSSAVOU KOMBILA

Pr. Ag. Philomène NKOUNA

SECRETAIRE GENERAL Mr. Alphonse RAIVIRE

SECRETAIRE GENERAL ADJOINT Mr. Apollinaire ESSONO

PERSONNEL ENSEIGNANT

RESPONSABLE DE SECTION Pr. Maryvonne KOMBILA

CORDINATEURS Dr. Adaku SITTI LIAMIDI

Mr. Christophe NGUIRI

ANATOMO-PATHOLOGIE

Drs: Barthélemy MABIKA MABIKA

Sidonie NGUIZI OGOULA Pearl NSIE OBAME

Florence NZE NGUEMA

HEMATOLOGIE-IMMUNO HEMATOLOGIE

Pr. Alain ONDO

Drs. Vincent DITSAMBOU

Léonie Esther LETOMBO

Jean-François THARDIN Mr. André DOUKAGA

PARASITOLOGIE-MYCOLOGIE-MEDECINE TROPICALE

Pr. Maryvonne KOMBILA

Drs Marielle Karine BOUYOU AKOTET ép.

LOUEMBET

Jean-Bernard LEKANA DOUKI

Modeste MABIKA MANFOUMBI

Denise Patricia MAWILI MBOUMBA

Jean-Romain MOUROU MBINA

Marie-Noëlle MOUSSAVOU BOUSSOUGOU ép.

MABIKA

Edgar Brice NGOUNGOU

Joseph NZAMBA

Solange NZENZE AFENE

Anne WALKER DEEMIN

Mr. Mathieu OWONO MEDANG

BACTERIOLOGIE-VIROLOGIE

Pr. Angélique NDOYI MBIGUINO

Drs. Delphine OMWANGA ép. IGONDJO

Pélagie MOUGOLA ép. SAPHOU DAMON

Mrs. Guy Francis NZENGUI NZENGUI

Hervé M'BOYIS KANDEM

Mme Agnès NNOH MBA

PHYSIQUE --BIOPHISIQUE-MATHMATIQUES-INFORMATIQUE

Drs Thaddée NTOUNTOUME

Boris ONDO

Mrs. Philippe ESSONO ONDO

Emmanuel ANYUNZOGHE

TOXICOLOGIE

Drs : Colette YENOT Casimir NZOUNGOU

CHIMIE-BIOCHIMIE-BIOLOGIE CELLULAIRE ET MOLECULAIRE

Pr. Edouard NGOU MILAMA

Drs. Madeleine BRIDON

Guy Joseph LEMAMY

Elisabeth LENDOYE

Yvette MBA OBAME

Marie-Claude MINKOUE

Jean-Claude MOUNDOUNGA BAKITA

Bénédicte NDEBOKO

Jean-Calvin NGUELE

Marie Andrée N'NEGUE

Félix OVONO ABESSOLO

Adaku SITTI LIAMIDI

PHARMACOLOGIE

Pr. Ag. Blandine AKENDEGUE Drs. Nadine AMBOUROUET Laurence GASSITA Pierre GOUERANGUE Serge ISSEMBE

Marie ONDO MBA

PHYSIOLOGIE

Pr. Berkman NSHIMIUMOUREMYI Drs. Apollinaire ESSONO

Serge BEKALE

SANTE PUBLIQUE ET MEDECINE DU TRAVAIL

Pr. Bernard OBIANG OSSOUBITA

Pr. Ag. Justine MOUECOUCOU

Drs. François EDOU OVONO

Médard TOUNG MVE

Mr. Jérôme MBA BITOME

Je dédie ce travail à : L'eternel Dieu

Maître et seigneur tout puissant, c'est lui qui permet toutes choses sur cette terre, notre créateur. OH SEIGNEUR !! Soit bénit et glorifié.

A ma mère AZIZET Jeanne Françoise et mon père RAKOMBA Arnaud

Pour votre soutient moral et financier, pour tous les sacrifices consentis pour mes études et mes multiples besoins, je vous dédie ce travail

A mon grand père ETENO Jean Bernard, mes oncles SYLONG Jean Richard et IKOUAKOUA Jules, à mes tantes NTCHANGO Félicité et Sylviane, NGUIZI OGOULA GERBEX Sidonie

Pour vos conseils, votre disponibilité, votre soutien sans faille à chaque que j'ai marqué le besoin, je vous dédie ce travail pour tous ces sacrifices consentis.

A mes frères et soeurs, cousins et amis, particulièrement à IGALLA Judicaël

Vous qui m'avez toujours remonté le moral lorsque je faiblissais, vous avez su m'apporter la joie, me donner du courage, je vous dédie ce travail

A mes condisciples de classe AVA Thierry, ANGOUO Ladislas, BATENI Julie, EMANE Alain-Georges, ETO'O Judicaël, IMOUNGA Audrey-Sylviane, KASSA Aubin, KEMDOUM.O Descartes, KOMBA.M Olive, LUMUMBA Clotilde, MABALA KABA Harry, MAPANGOU Nelly, MBEGA Auxence, MUSWAMI.B Laeticia, NDONG Jean-Charles, NZAOU Denise, NZIENGUI Eric

Pour tous les moments de joies et de peines passés ensemble et pour votre soutien qui a été sans faille, sincères remerciements.

A ma fiancée ONKANI Shirley Priscilla

Toi qui a cru en moi des le jour ou l'on s'est rencontré, pour ta présence, ton soutien, tes conseils et ta patience, reçoit toutes ma gratitude et mon amour pour toi, je te dédie ce travail

REMERCIEMENTS

A mon directeur de mémoire
Pr Angélique NDJOYI MBIGUINO
Pour avoir dirigé ce travail avec patience et rigueur,
Vous nous avez accordé votre précieux temps malgré vos multiples occupations

Au responsable de la section TSBM
Pr Maryvonne KOMBILA
Vous avez toujours été à l'écoute des étudiants,
Vous avez de grandes qualités humaines,
Vous ne cessez de nous soutenir et de vous montrer attentionné envers nous

telle une mère

A mon rapporteur
Dr Modeste MABIKA MAMFOUMBI
Vous avez voulu nous accorder de votre temps,
Pour juger ce travail avec toute la rigueur scientifique.
Sincère remerciement

Au Dr Pélagie SAPHOU DAMON
Pour votre apport, votre disponibilité et vos conseils
tout au long de ce travail, vous avez été telle une grande soeur.
Je vous adresse mes sincères remerciements

A messieurs NZENGUI NZENGUI GUY-FRANCIS,

MBOYIS KANDEM Hervé,

A Mesdames NNOH MBA Agnes,

TCHOUA Diane,

Makessi Adele,

NGOUANGA Leonie,

MASSOUNGA Jeannine,

Pour votre contribution technique au cours de ces mois passé ensemble,

Pour votre sens de la fraternité et de la famille envers nous,

Votre souci de travailler en équipe,

Profonds remerciements.

Liste des abréviations

ORL : Oto-rhino-laryngologie

CMI : Concentration Minimale Inhibitrice

VP : Voges Proskaeur (production d'acétone)

LCR : Liquide Céphalorachidien

PSDP : Pneumocoque de Sensibilité Diminuée à la Pénicilline.

USA: United States of America

NAD: Nicotinamide Adenine Dinucléotide

PLP : Protéine de Liaison à le Pénicilline

ADN : Acide Désoxyrinucléique

FQ : Fluoroquinolones

ARN : Acide Ribonucléique

CO2 : Dioxyde de carbone

APH : Aminoside-phosphotransférases

ANT : Aminoside-nucléotidyl- transférase

ACC : Aminoside-acetyltransferases

D-Ala-D-Ala : D-Alanine-D-Alanine

D-Ala-D-Ser : D-alanine-D-serine

MLS : Macrolides-lincosamides- synergistines

CASFM : Comité de l'antibiogramme de la société française de microbiologie.

Liste des tableaux pages

Tableau I: Répartition des cas dans la population générale 42

Tableau II: Répartition des cas selon les tranches d'âge 43

Tableau III: Antibiogramme et CMI de la souche de S. pneumoniae ONA 45

Tableau IV: Antibiogramme et CMI de la souche de S. pneumoniae AYO 46

Tableau V: Antibiogramme et CMI de la souche de S. pneumoniae MAH 46

Tableau VI: Antibiogramme et CMI de la souche de S. pneumoniae MAN 47

Tableau VII: Antibiogramme et CMI de la souche de S. pneumoniae BOU 47

Tableau VIII: Antibiogramme et CMI de H. influenzae 48

Liste des figures pages

Figure 1: Colonies de S. pneumoniae sur gélose au sang 7

Figure 2: Coloration de Gram de Streptococcus pneumoniae 8

Figure 3: Coloration de Gram de Haemophilus influenzae 14

Figure 4: Image d'un test de CMI 34

Figure 5: Répartition des cas positifs selon les espèces 44

MENES-USS-FM-DBV Mémoire n°2 59 présenté par ONDENOT Yann Christian

Surveillance de la résistance aux antibiotiques de Streptococcus pneumoniae et Haemophilus influenzae

Introduction 4

Objectifs 5

Chapitre I:Généralités 6

I.1-Généralités sur Streptococcus pneumoniae 6

I.1.1-Historique 6

I.1.2-Définition et classification 6

I.1.3-Morphologie et caractères biochimiques 6

I.1.4-Caractère _génomi_que 9

I.1.5-Habitat 9

I.1.6-Pouvoir patho_gène 9

I.1.7-Facteurs de pathogénicité 10

I.1.7.1-La capsule 10

I.1.7.2-Autres facteurs 10

I.1.8-Manifestations clini_ques 10

I.1.9-Diagnostic bactériologique 10

I.1.9.1-Prélèvement 11

I.1.9.2-Transport 11

I.1.9.3-Dia_gnostic 11

I.1.10-Traitement et prévention 12

I.2-Généralités sur Haemophilus influenzae 13

I.2.1-Histori_que 13

I.2.2-Définition et classification 14

I.2.3-Morpholo_gie et caractères biochimi_que 14

I.2.4-Habitat 15

I.2.5-Pouvoir patho_gène 15

I.2.5.1-Infection des voies respiratoires 15

I.2.5.2-Ménin_gites 15

I.2.5.3-Autres localisations 16

I.2.6-Facteurs de patho_génicité 16

I.2.7-Manifestations cliniques 16

I.2.8-Dia_gnostic bactériolo_gi_que 17

I.2.8.1-Prélèvement 17

I.2.8.2-Transport au laboratoire 17

I.2.8.3-Diagnostic 17

I.2.9-Traitement et prévention 18

I.3-Généralités sur les antibiotiques 19

I.3.1-Historique 19

I.3.2-Définition 19

I.3.3-Classification 20

I.3.3.1-Classification selon les familles 20

I.3.3.2-Classification selon le site d'action 21

I.3.4-Mécanisme d'action des antibioti_ques 21

I.3.4.1-Action sur la paroi bactérienne 21

I.3.4.1.1-Beta-lactamines 22

I.3.4.1.2-Glycoprotéines 22

1

I.3.4.1.3-Fosfomycine 23

MENES-USS-FM-DBV Mémoire n°2 59 présenté par ONDENOT Yann Christian

Surveillance de la résistance aux antibiotiques de Streptococcus pneumoniae et Haemophilus influenzae

I.3.4.2-Antibiotiques actif sur la synthèse des protéines et des acides

nucléiques 23

I.3.4.2.1-Mécanisme d'action des aminosides 24

I.3.4.2.2-Mécanisme d'action des quinolones 24