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Fouille de données biologiques. étude comparative et expérimentation.


par Abdelhak MANSOUL
Université Ahmed Ben Bella Oran 1, Algérie - Magister Informatique et Automatique 2010
  

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Conclusion générale

Nous avons abordé dans ce mémoire une nouvelle problématique qui consiste à fouiller des données biologiques avec post-traitement des règles extraites pour optimiser le stockage et la gestion. L'objectif que nous nous sommes fixé était de proposer une solution appuyée par des travaux antérieurs de modélisation booléenne selon le principe cellulaire de la machine CASI.

Nous nous sommes basés sur une fouille à l'aide de l'algorithme Apriori qui fonctionne par itération, i.e., l'extraction des k-itemsets fréquents à partir des k-1 Itemsets fréquents. Alors, n itérations sont faites pour extraire la totalité des itemsets fréquents, avec n-1 la taille du plus long itemset fréquent. A chaque itération, un ensemble d'items candidats est généré à partir des itemsets fréquents du niveau précédent.

Ceci dit, l'objectif de ce mémoire était aussi de présenter l'état de l'art de notre thème de recherche, de faire une étude comparative afin de soulever la problématique de la représentation des données biologiques qui ne sont en fait dans une structure de donnée standard, connue et théorisée en informatique. Nous avons alors consacré le premier chapitre pour l'ECD biologiques qui travaille sur un nouveau type de donnés si l'on peut dire « non usuel » et nous avons visé particulièrement des données se rapportant à une épidémie qui est la tuberculose afin de tester ultérieurement en réel, ce qui nous à fait faire une prospection de ces données et tirer des constatations utiles pour la suite de notre étude surtout pour les étapes nettoyage et prétraitement de l'ECD.

Ensuite, nous avons fait une étude comparative et avons abordé l'extraction des règles d'association, et leur optimisation par le module BRI qui constitue le support de notre solution pour le post-traitement en fouille de données.

Notre étude se voulait être assez novatrice, dans la mesure où nous avons été incités à utiliser des techniques prouvées de la machine cellulaire CASI, combinées à une fouille de données. De ce fait, deux objectifs nous ont guidés dans la proposition d'un automate cellulaire pour l'optimisation, la génération, la représentation et la gestion d'une base de règles d'association. En effet, le premier c'est d'avoir une base de règles optimisée et des temps de traitements assez réduits grâce aux principes de représentation booléenne, et le deuxième c'est d'apporter une contribution à la construction des systèmes à base de connaissances en adoptant une nouvelle technique

Conclusion générale - 72 -

cellulaire.

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