Tomodensitométrie thoracique et gravité de la covid-19 au CHR Lomé commune

MINISTÈRE DE L'ENSEIGNEMENT FACULTÉ DES SCIENCES RÉPUBLIQUE TOGOLAISE

SUPÉRIEUR ET DE LA RECHERCHE DE LA SANTÉ (FSS) Travail-Liberté-Patrie

	LOMÉ - TOGO

ANNEE 2022 MEMOIRE N°......../RIM/22

TOMODENSITOMETRIE THORACIQUE

ET GRAVITE DE LA COVID-19 AU CHR

LOME COMMUNE

MÉMOIRE

PRÉSENTÉ ET SOUTENU PUBLIQUEMENT LE 14 DECEMBRE 2022
POUR L'OBTENTION DU

Diplôme d'Etudes Spécialisées (D.E.S.) DE RADIOLOGIE ET IMAGERIE MÉDICALE (DIPLÔME D'ETAT)

PAR

Dr MBAÚAOURÉ Barak Boukar

Né à SARH (Tchad)

EXAMINATEURS DE MEMOIRE

Professeur K. E. ADJENOU PRESIDENT DU JURY

Professeur A. AMADOU JUGE

M.C.A S. PESSINABA JUGE

Professeur L. SONHAYE DIRECTEUR DE MEMOIRE

MINISTÈRE DE L'ENSEIGNEMENT SUPÉRIEUR ET DE LA RECHERCHE	FACULTÉ DES SCIENCES DE LA SANTÉ (FSS)	RÉPUBLIQUE TOGOLAISE Travail-Liberté-Patrie
	LOMÉ - TOGO

ANNÉE UNIVERSITAIRE 2022-2023

ADRESSE

BP 1515

Tél [phone]

Fax [phone]

50	94 /	22	25	13	66
85	95 /	22	25	13	66

LOMÉ-TOGO

EMAIL [e-mail]

DÉCANAT

DOYEN M. T. DARRE, Professeur Titulaire

1er VICE-DOYEN M. A. DIALLO, Professeur Titulaire

2èmeVICE-DOYEN M. P. P. AGODA, M.C.A.

CHEF DES SERVICES ADMINISTRATIFS M. A. F. PIO

CHEFS DE DÉPARTEMENTS

MÉDECINE ET SPÉCIALITÉS MÉDICALES M. O. ONIANKITAN, Professeur Titulaire

PÉDIATRIE K. E. DJADOU, Professeur Titulaire

CHIRURGIE ET SPÉCIALITÉS CHIRURGICALES M. B. TCHANGAÏ M.C.A.

GYNÉCOLOGIE ET OBSTÉTRIQUE (par intérim) M. B. DOUAGUIBE, M.C.A.

SCIENCES FONDAMENTALES ET BIOLOGIQUES M. L. FETEKE, M.C.A.

PHARMACIE M. B. BAKOMA, Professeur Titulaire

SANTÉ PUBLIQUE M. K. EKOUEVI, Professeur Titulaire

ODONTOLOGIE STOMATOLOGIE M. P. P. AGODA M.C.A.

LMD (LICENCE - MASTER - DOCTORAT)

PARCOURS MÉDECINE M. E. BOKO, Professeur Titulaire

PARCOURS PHARMACIE M. M. SALOU, Professeur Titulaire

CIP MÉDECINE M. F. DAMOROU, Professeur Titulaire

CIP PHARMACIE M. Y. POTCHOO Professeur Titulaire

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 I

CORPS ENSEIGNANT DE LA FSS

DE L'ANNÉE UNIVERSITAIRE 2022-2023

A- DOYENS HONORAIRES

Professeur K. KEKEH (1971-1980) (In memoriam)

Professeur A. AMEDOME (1980-1986) (In memoriam)

Professeur N. NAKPANE (1986-1987) (In memoriam)

Professeur A. M. D'ALMEIDA (1987-1990) (In memoriam)

Professeur K. KESSIE (1990-1997)

Professeur K. JAMES (1997-2002)

Professeur K. N'DAKENA (2002-2014)

Professeur K. ATTIPOU (2014-2016)

Professeur A. D. AGBÈRÈ (2016-2019) (In memoriam)

Professeur M.N.I. WATEBA (2019-2020)

Professeur N. K. DOUTI (2020-2022)

B- ENSEIGNANTS HONORAIRES

Professeur S. KPODZRO Anatomie Pathologique (In memoriam)

Professeur S. AHOUANGBEVI Anesthésie-Réanimation

Professeur K. GNAMEY Pédiatrie-Génétique (In memoriam)

Professeur M. EDEE Biophysique (In memoriam)

M.C.A. E. HODONOU Gynécologie et Obstétrique (In memoriam)

Professeur S. BOUKARI Histologie-Embryologie

Professeur K. TATAGAN-AGBI Pédiatrie

Professeur S. M. BAETA Gynécologie et Obstétrique (In memoriam)

Professeur K. ASSIMADI Pédiatrie (In memoriam)
Professeur D. AMEDEGNATO Endocrinologie

M.C.A. B. I. L. SOUSSOU Cardiologie (In memoriam)

M.C.A. K. AGBO Parasitologie

Professeur A. AGBETRA Médecine Interne (In memoriam)

Professeur O. TIDJANI Pneumo-Phtisiologie (In memoriam)

Professeur K. GRUNITZKY Neurologie (In memoriam)

Professeur K. TCHANGAI-WALLA Dermatologie-Vénéréologie

Professeur A. AYITE Chirurgie Générale

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 II

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 III

Professeur

	M.	PRINCE-DAVID	Bactériologie-Virologie
Professeur	A.	TEKOU	Chirurgie Pédiatrique
Professeur	A.	DOSSIM	Traumatologie-Orthopédie
M.C.A.	Y.	KASSANKOGNO	Santé Publique/Epidémiologie
M.C.A.	M.	BANLA	Ophtalmologie
Professeur	E.	GOEH-AKUE	Cardiologie
M. A.	A. B.	ADAMA-HONDEGLA	Gynéco-Obstétrique (In memoriam)				M.C.A.
K.	FOLLIGAN	Histo-Embryologie (In memoriam)	Professeur
B.	BAKONDE	Pédiatrie (In memoriam)
Professeur	A. K.	SEGBENA	Hématologie (In memoriam)					Professeur
B.	BALAKA	Pédiatrie
Professeur	K. D.	TOMTA	Anesthésie- Réanimation
Professeur	K.	AKPADZA	Gynécologie et Obstétrique
Professeur	D.	REDAH	Hépato-Gastro-Entérologie
Professeur	B.	SONGNE-GNAMKOULAMBA Chirurgie Générale
Professeur	E.	KPEMISSI	Oto-Rhino-Laryngologie / CCF
Professeur	Y.	POTCHOO	Pharmacologie
A.C.C.	K.	KARA-PEKETI	Médecine du Travail,
Professeur	K.	BALO	Ophtalmologie
Professeur	A.	VOVOR	Hématologie
Professeur	G. A.	NAPO-KOURA	Anatomie Pathologique
Professeur	D. Y.	ATAKOUMA	Pédiatrie						Professeur
M.	BELO	Neurologie

C- ENSEIGNANTS RESIDENTS

1 Professeurs Titulaires:

M.M A. M. MIJIYAWA Rhumatologie

P. PITCHE Dermatologie-Vénérologie

A. GBADOE Pédiatrie

A. BALOGOU Neurologie

E. D. J. DOSSEH Chirurgie Générale

K. GNASSINGBE Chirurgie Pédiatrique

F. DAMOROU Cardiologie

S. K. DASSA Psychiatrie d'adulte

K. E. ADJENOU Radiologie- Imagerie Médicale

O. ONIANKITAN Rhumatologie

G. K. AKAKPO-NUMADO Chirurgie Pédiatrique

L. K. AGODA-KOUSSEMA Radiologie et Imagerie Médicale

E. BOKO Oto-Rhino-Laryngologie / CCF

A. Y. DAGNRA Bactériologie Virologie

A. ABALO Traumatologie-Orthopédie

Mme K. KOMBATE Dermatologie-Vénérologie

M.M K. AMEGBOR Anatomie Pathologique

M. A. DJIBRIL Médecine Interne

M. N. I. WATEBA Maladies Infectieuses

K. D. AYENA Ophtalmologie

K. E. DJADOU Pédiatrie et Génétique médicale

M. SALOU Bactériologie Virologie

K. ASSOGBA Neurologie

B. BAKOMA Pharmacognosie

L. SONHAYE Radiologie Imagerie Médicale

K. EKOUEVI Santé Publique

A. WALLA Chirurgie Orthopédique et
Traumatologie

B. SAKA Dermatologie-Vénérologie

T. DARRE Anatomie Pathologique

N. K. DOUTI Pédiatrie

B. AMANA Oto-Rhino-Laryngologie / CCF

S. BARAGOU Cardiologie

A. DIALLO Toxicologie

K. S. ADJOH Pneumologie

K. ADAMBOUNOU Biophysique - Médecine Nucléaire

A. BALAKA Médecine Interne

A. BAGNY Hépato-Gastro-Entérologie

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 IV

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 V

2 Maîtres de Conférences Agrégés:

M. M. KOLOU Immunologie

Mme A. DORKENOO Parasito-Mycologie Médicale

K. ADABRA Chirurgie Générale

E. KPELAO Neurochirurgie

K. TENGUE Urologie - Andrologie

N. MANEH Ophtalmologie

B. TCHANGAÏ Chirurgie Viscérale

L. FETEKE Biochimie

P. P. AGODA Chirurgie Buccale

K. M. A. SOEDJE Psychiatrie d'adulte

K. A. SABI Néphrologie

H. BISSA Chirurgie maxillofaciale/stomatologie

Mme E. FIANYO Rhumatologie

M.M. K. A. SAKIYE Chirurgie Générale

F. ALASSANI Chirurgie Viscérale

A. K. A. AMAVI Chirurgie Générale

D. H. SAMA Anesthésie-Réanimation

G. AYOUBA Traumatologie Orthopédie

K. A. DJAGADOU Medécine Interne

E. PADARO Hematologie Biologique

K. DZIDZINYO Ophtalmologie

S. ADAM Chirurgie maxillofaciale/Stomatologie

T. A. S. ADAMBOUNOU Pneumologie

K. APETSE Neurologie

B. BAKRIGA Traumatologie-Orthopédie

A. K. DOLEAGBENOU Neurochirurgie

B. DOUAGUIBE Gynécologie-Obstétrique

M. FIAWOO Pédiatrie

K. M. GUEDENON Pédiatrie

Mme V. E. S. KOFFI-TESSIO Rhumatologie

M.M. L. M. LAWSON-ANANISSOH Hépato-Gastro-Entérologie

E. P. PEGBESSOU Oto-Rhino-Laryngologie - CCF

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 VI

S. PESSINABA Cardiologie

E. V. SEWA Urologie - Andrologie

Maîtres-Assistants des Services Universitaires des Hôpitaux:

Mme E. TSOLENYANU Pédiatrie

MM. T. GUEDEHOUSSOU Pédiatrie

M. D. I. KUEVIAKOE Hématologie clinique,

Hématologie biologique

Mme K. LAWSON-EVI Pédiatrie

MM. E.Y. JAMES Anatomie Organogenèse

A. A. PATASSI Maladies Infectieuses

K. B. NONON-SAA Ophtalmologie

M.M Y. M. AGBO Parasitologie Mycologie

K. GUINHOUYA Neurologie

F. AGBEKO Pédiatrie

P. EGBOHOU Anesthésie -réanimation

A. G. GBADAMASSI Pneumologie

MM N. K. KOMBATE Traumatologie-Orthopédie

O. E. TAKASSI Pédiatrie

K. YAYEHD Cardiologie

Mmes. A. S. AKAKPO Dermatologie-Vénérologie

J. N. TECLESSOU Dermatologie-Vénérologie

MM Y. Y. DELLANH Traumatologie-Orthopédie

W. FOMA Oto-Rhino-Laryngologie - CCF

P. GBANDE Radiologie - Imagerie Médicale

Y. LAYIBO Hématologie

S. SALIFOU Psychiatrie

E. Y. O. AMOUZOU Chirurgie Générale

A. BASSOWA Gynécologie-Obstétrique

K. AFANVI Santé Publique

K. A. AZIAGBE Pneumologie

K. S. AMOUZOU Chir. Plast. Rec. Esthétique

Mme L. K. NADJIR Immunologie générale

Mmes D. A. AKOLLY Pédiatrie

F. A. GBEASOR épse KOMLANVI Epidémiologie

A. A. KETEVI Gynécologie-Obstétrique

MM D. LAMBONI Chirurgie Thoracique

K. D. NEMI Médecine Interne

M. A. K. SANTOS Ophtalmologie

Mme N. K. TITTIKPINA Chimie analytique

M.M L. D. BAWE Maladies Infectieuses

Y. M. TSEVI Néphrologie

A. DERMANE Chimie Organique

Mme O. ADANI-IFE épse DOLEAGBENOU Oncologie Médicale

M. Y. M. AFASSINOU Cardiologie

Chefs de Clinique-Assistants de Faculté - Assistants des Services Universitaires des Hôpitaux:

MM. M. TCHAO Phytopharmacie

K. FIAGNON Gynécologie et Obstétrique

H. ASSANE Physiologie

S. A. ISSA Biologie Générale

H. MAGNANG Hématologie

M. YERIMA Pharmacologie

Y. A. AGBOBLI Médecine du travail

M.M P. KOUGNASSOUKOU TCHARA Biochimie (Pharmacie)

K. M. KOWOUVI Pharmacie galénique

K. A. MIHLUEDO-AGBOLAN Chirurgie Pédiatrique

Mme S. W. VIDJRO Droit et Déontologie

M.M. A. SOGAN Anatomie Organogenèse

D. N'BOUKE Hystologie-Embryologie

A. KOTOSSO Maladies infectieuses

B. BETENORA Odontologie preventive
et sociale

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 VII

K. M. BOUSSALO Prothèse Maxillo-faciale

S. A. FAGBEGNON Parodontologie

P. HEMOU Odontologie Pédiatrique

B. KEBINA Orthopédie Dento-Faciale

B. J. N'BOUKE Odontologie conservatrice

Endodontie

D- ENSEIGNANTS DE LA FACULTE DES SCIENCES ET TECHNIQUES

Professeurs Titulaires:

MM. M. GBEASSOR Physiologie Générale

K. BATAWILA Botanique

K. NAPO Physique

M. G. TCHANGBEDJI Chimie Générale

B. BONDJOU-DJANEYE Chimie Générale et Analytique

K. JONDO Chimie Minérale

D. S. KAROU Biochimie Générale et Médicale

Maîtres de Conférences:

MM. W. POUTOULI Parasitologie-Entomologie

A. AIDAM Biologie Végétale

O. SIMALOU Chimie Organique

K. E. KOLEDZI Chimie Minérale

Maîtres-Assistants:

MM. K. AFIADEMANYO Zoologie

E - FACULTÉ DES LETTRES, LANGUES ET ARTS (FLLA) (DÉPARTEMENT D'ANGLAIS)

Professeur Titulaire:

M. K.E. ESSIZEWA Anglais medical
English for Specific Purposes (ESP)

MM. K. HENEKOU Anglais médical

D. A. SOWAH Anglais médical

D. YELOU Anglais médical

V. D. SOKPOH Anglais médical

D. LARE Anglais médical

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 VIII

Y. OURO-KOURA Anglais médical

K. K. AHONDO Anglais medical

F- ENSEIGNANTS NON RESIDENTS

Professeurs Titulaires:

MM. S. K. AMOUZOU Biochimie Nutrition (KARA)

Dj. FALL Chimie Thérapeutique (DAKAR)

Y. DIOP Chimie Analytique, Bromatologie, Analyse Instrumentale
(DAKAR)

LISTE DES ENSEIGNANTS VACATAIRES ET
CHARGÉS DE COURS DE LA FSS-UL 2022-2023

Enseignants vacataires:

Professeur K. JAMES Anatomie Organogenèse
Chargés de cours et Travaux Dirigés

K. AGBOSSE Informatique

K. ABOTCHI Pharmacie Vétérinaire

K. A. KIVI Parasitologie

A. TOSSOU Informatique

Mme A. KOULETE Soins Infirmiers

M. K. W. GAGLO Soins Infirmiers

Liste établie le 28 novembre 2022

Le Doyen

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 IX

Professeur DARRE Tchin

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 X

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

DEDICACES

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 XI

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

A l'ETERNEL DIEU TOUT-PUISSANT : la fin d'une chose vaut mieux que son commencement. Tu es l'alpha et l'oméga de cette oeuvre. Sois bénis Dieu des cieux pour ta fidélité dans tous les domaines de ma vie.

A mon épouse SOLKEM Lydie : Tu as été d'une aide et d'un appui précieux pour moi durant toutes ces années supplémentaires de formation post doctorale. Ton soutien indéfectible est et sera une bénédiction pour Samuel et moi. Ce travail est aussi le tien.

A mon fils bien aimé MBAINODJI Ted Samuel Boukar : papa n'était pas là pendant ta première année de vie et c'était difficile pour nous deux. C'est pour t'assurer un avenir radieux fils ! J'espère et je crois que tu feras plus que papa. Merci pour ta venue qui a enfin essuyé nos larmes après 10 années d'attente.

A mon père le pasteur BOUKAR Barka : Je te dois tout papa car tu es mon modèle sur cette terre. Merci d'avoir veillé sur Samuel et sa maman pendant mon absence.

A maman NÉPIDÉ Viviane : femme bénie, grand-mère d'une multitude et maman des docteurs, sois célébrée pour l'amour que tu nous porte.

A mes soeurs Hortense, Angéline, Eveline et leurs époux respectifs : recevez ce travail comme le vôtre ; je vous ai toujours sentis tout à côté durant mon cursus, l'Eternel vous le rendra certainement.

A mon frère cadet Dr Junias Ronduba Boukar et son épouse : tu as toujours vu en moi un modèle à suivre dans bien de domaines. Le chemin de la spécialisation t'est aussi ouvert et je serai là pour t'orienter si tu le souhaite.

A mes neveux et nièces Rasheed, Marie, Esther, Seydou, Derreck, Josué, Kezias, Nafissa, Caleb, Moise, Keren et Jemima vous avez toujours fait ma fierté. Que Dieu vous fasse grandir dans la crainte de sa parole et continuez de faire la joie de mes soeurs et de votre oncle que je suis.

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 XII

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

REMERCIEMENTS

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 XIII

A Son Excellence le Général d'Armée Mahamat Idriss Deby Itno
Président de la République du Tchad

Chef Suprême des Armées

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 XIV

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Ø Au Général d'Armée ABAKAR Abdelkerim Daoud : Chef d'Etat-Major

Général des Armées du Tchad.

Ø Au Médecin-Général de Brigade SALIM Ossou : Directeur du Service de Santé des Armées et de l'Action Sociale du Tchad.

Ø Au Médecin Colonel NODJIMBAYE Bangatingar Joel : Directeur de l'Hôpital Militaire d'Instruction de N'Djamena.

Ø Au Médecin Lieutenant-Colonel HISSENE Allamine : Chef de Service de Radiologie de l'Hôpital Militaire d'Instruction de N'Djamena.

Ø Au Médecin Lieutenant-Colonel MACAMANZI Laroutoki : Directeur du Centre Hospitalier Régional Lomé Commune.

Ø Aux enseignants de la filière radiologie et imagerie médicale des facultés de sciences de la santé du Togo notamment Pr ADJENOU, Pr AGODA-KOUSSEMA, Pr SONHAYE, Pr TCHAOU, Pr AMADOU, Pr ADAMBOUNOU, MCA N'TIMON, Dr DAGBE et Dr GBANDE.

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 XV

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Ø Aux Professeurs AGODA-KOUSSEMA et TCHAOU Mazamaesso

Mes mentors dans ce département vous l'êtes à plus d'un titre chers maitres. Merci pour la confiance placée en ma modeste personne en m'associant étroitement à la gestion aussi bien de la STRIM que de la SRANF. A vos côtés, j'ai appris la gestion d'une société savante. Que le Seigneur vous fortifie davantage dans ce sacerdoce.

Ø Au Dr KOTOSSO Awèreou

Merci pour tout cher ancien, ce travail est surtout le vôtre mon commandant.

Ø Aux Dr DANSOU, WATTARA et TAMOU-TABE, Merci de nous avoir accompagné durant notre formation.

Ø A mes ainées du DES et amies de tous les jours, Dr DOSSEH et Dr NABEDE

Merci pour les mots d'encouragement à chaque étape, merci pour l'amitié et la complicité au-delà des liens tissés dans le DES. Soyez rassurées de mon affection et de ma disponibilité pour vous chères associées.

Ø A mon ami, frère et cochambreur le Dr Nodjiath Naobé EMERY, ce travail est surtout le tien. Merci pour ces belles années supplémentaires passées ensemble en dehors de notre mère patrie.

Ø A mes promotionnaires du DES RIM-TOGO (9^e promotion)

Merci pour le chemin parcouru ensemble. Qu'au-delà de ce DES, perdurent les liens créés. Puisse le Seigneur nous guider dans notre carrière. Merci d'avoir fait de moi votre premier responsable durant ces quatre belles années.

Ø A mes ainés du DES RIM-TOGO, en particulier les Drs BATE-LARE, YOUALEU, N'TANKEU, CHIDORO, LINJOUOM et SABI Merci pour les enseignements, le temps consacré et la confraternité.

Ø A mes cadets du DES RIM, en particulier les Drs AHONHYI, MAHAMADOU, KOUZOU, AKPO, TCHINDA, AKUE et SATNEY Merci pour la collaboration. Je vous souhaite une bonne suite dans le DES.

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 XVI

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Ø A tous mes compatriotes en cours de spécialisation au Togo, cultivez l'excellence et ensemble nous hisserons haut le flambeau de l'école de Lomé.

Ø A tout le personnel des différents services de radiologie : du CHU Campus, du CHU-SO, de la Polyclinique le Coeur, de la Polyclinique Saint Joseph, de la clinique Bonté et du CHR de Kara.

Ø Au Dr Ali et l'externe Jeannette, merci pour votre précieux coup de main

Ø Aux secrétaires du CHU campus : Mme POGBO et Mme BARARMNA Merci pour tout le service rendu pendant les différentes étapes de la rédaction de ce mémoire ; Dieu vous le rendra certainement.

Ø Aux Drs OUSMANE, KEMKOI, MATELBE et BITINAN, merci pour ces anciens et ainés modèles pour moi et ce, depuis mes premiers pas à l'ESSAL jusqu'à ce jour.

Ø Aux frères et soeurs de l'Union des Chrétiens Tchadiens au Togo : demeurez fermes dans la foi et le Seigneur guidera vos pas.

Ø A Tous ces jeunes Tchadiens de Lomé qui oeuvrent dans l'ombre : Adoua, Anaïs, Mauricienne, Raissa, Roland, et Bienvenue Merci

Ø A la Faculté des Sciences de la Santé de l'Université de Lomé : Plus qu'une faculté d'études médicales, tu as été pour moi une école de formation pour la vie. Tu avais fait de moi un médecin généraliste et tu fais encore de moi un médecin spécialiste ; Je ferai partout ta fierté.

Ø A tous ceux qui ont diversement contribué à la réalisation de ce travail.

Ø A tous ceux qui me sont chers et que j'ai involontairement omis de citer.

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 XVII

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

A NOS MAITRES

ET JUGES

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 XVIII

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

A notre Maître et Président du Jury

Monsieur le Docteur ADJENOU Komlanvi Etteh

Professeur Titulaire de Radiologie à la Faculté des Sciences de la Santé de

l'Université de Lomé.

Coordonnateur du Diplôme d'Etudes Spécialisées de Radiologie et Imagerie Médicale

Médecin-Chef du service de Radiologie au Centre Hospitalier Universitaire-Campus

Vous nous faites un grand honneur en acceptant de présider ce jury. Votre disponibilité permanente, votre sens aigu de leadership, votre modestie et votre ardeur pour le travail bien fait, font de vous un homme plein d'humanisme, un encadreur remarquable et un maître respecté. Vos sages conseils nous ont été d'une très grande utilité. Que Dieu nous permette de profiter de vos connaissances le plus longtemps possible. Qu'il soit l'occasion pour nous de vous exprimer notre plus profonde gratitude et notre respect.

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 XIX

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

A notre Maître et Juge

Monsieur le Dr AMADOU Abdoulatif

Professeur Titulaire de Radiologie et Imagerie Médicale à la

Faculté des Sciences de la Santé de l'Université de Kara.

Médecin-Chef du Service de Radiologie et Imagerie Médicale du Centre Hospitalier Régional de Kara.

Nous vous remercions sincèrement de l'honneur que vous nous faites en acceptant de siéger dans ce jury. Votre facilité d'abord et votre capacité à transmettre aisément vos connaissances font de vous un maître incontournable en imagerie et radiodiagnostic. Votre calme et votre simplicité n'ont d'égales que votre culture scientifique. Nous avons bénéficié de vos savoirs en imagerie, surtout lors des staffs matinaux, lors de notre stage rural dans votre service à Kara et à la clinique Bonté ; nous somme fier d'être compté parmi vos élèves. Veuillez trouver dans ces quelques mots, cher maître, l'expression de notre profond respect.

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 XX

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

A notre Maître et Juge

Monsieur le Docteur Soulemane PESSINABA

Maitre de Conférences Agrégé de cardiologie à la Faculté des Sciences de la Santé de l'Université de Lomé.

Médecin cardiologue en service au Centre Hospitalier Préfectoral d'Aného Spécialiste en rythmologie et stimulation cardiaque, cardiologue du sport Médecin Commandant des Forces Armées Togolaises

Nous somme sensible à l'honneur que vous nous faites en acceptant de juger ce travail. Votre simplicité, votre discrétion, votre disponibilité et votre rigueur dans le travail sont des qualités qui vous précèdent et que nous admirons mon commandant.

Veuillez accepter cher Maître, l'assurance de notre profond respect.

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 XXI

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

A notre Maître et Directeur de mémoire Monsieur le Docteur SONHAYE Lantam

Professeur Titulaire de Radiologie et Imagerie Médicale à la Faculté des Sciences de la Santé de l'Université de Lomé.

Chef adjoint du service de Radiologie et Imagerie Médicale du Centre Hospitalier Universitaire Campus.

Président de la Société Togolaise d'Ultrasonographie Médicale (STUM) Médecin Lieutenant-Colonel des Forces Armées Togolaises.

Vous avez accepté nous confier ce travail en nous encadrant comme un petit frère. Vous avez toujours été disponible pour nous malgré vos occupations. Votre clarté d'esprit, votre rigueur scientifique, vos qualités de pédagogue rompu et votre amour du travail bien fait forcent l'admiration. Merci pour la confiance que vous nous faites d'apprendre à vos côtés et pour tout ce que vous faites pour nous assurer une formation de qualité. Puissiez-vous trouver ici l'expression de notre reconnaissance mon colonel. Que le Seigneur vous accorde une longue vie en bonne santé.

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 XXII

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Sommaire

DEDICACES .X

REMERCIEMENTS ..XII

LISTES DES ABREVIATIONS, SIGLES ET ACRONYMES . ..XXIV

LISTE DES TABLEAUX. .XXVI

LISTE DES FIGURES . XXVIII

INTRODUCTION 1

I - GENERALITES . .5

1.1 Généralités sur le coronavirus ...6

1.2 Clinique 10

1.3 Formes cliniques 11

1.4 Paraclinique . 12

II - METHODOLOGIE 18

2.1 Cadre d'étude 19

2.2 Patients et méthode d'étude .23

III - RESULTATS . ....31

3.1 Aspects épidémiologiques 32

3.2 Aspects cliniques .....34

3.3 Aspects paracliniques 36

3.4 Particularités des patients admis à la réanimation 45

3.5 Particularités des patients décédés 52

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 XXIII

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

IV - DISCUSSION	56
4.1 Méthodologie	57
4.2 Aspects épidémiologiques	57
4.3 Aspects cliniques	.....60
4.4 Aspects paracliniques	61
4.5 Facteurs cliniques et biologiques de gravité	64
4.6 Facteurs scanographiques de gravité	64
4.7 Facteurs cliniques et scanographiques de mortalité	.65
CONCLUSION	66
SUGGESTIONS .	68
REFERENCES	70
ANNEXES	80

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

LISTES DES ABREVIATIONS, SIGLES ET ACRONYMES

% : Pourcent

ACE : Antigène carcinoembryonnaire

ALARA : As Low As reasonably achievable

ALAT : Alanine amino-transferase

ARN : Acide ribonucléique

ASAT : Aspartate amino-transferase

CHR-LC : Centre Hospitalier Régional de Lomé Commune

CHU Campus : Centre Hospitalier Universitaire Campus

CHU-SO : Centre Hospitalier Universitaire Sylvanus Olympio

CRP : C- Réactive Protein

Covid-19 : Coronavirus Disease 19

Cm : Centimètre

cpm : Cycle par minute

DPP-4 : Dipeptidylpeptidase-4

EPI: Equipements de protection individuelle

FR : Fréquence respiratoire

HTA : Hypertension artérielle

IC : Intervalle de confiance

IDE : Infirmier diplômé d'état

KV : Kilovolt

mm³ : millimètre cube

mm : millimètre

ug : microgramme

n : Effectif

NC : Nucléocapside

PDC : Produit de contraste

RC: Rapport de côtes

RCa : Rapport de côtes ajusté

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ROI : Région Of Interest

RT-PCR : Reverse Transcription- Polymerase Chain Reaction

SARS-COV-2 : Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2

SDRA : Syndrome de détresse respiratoire aigüe

SIT : Société d'Imagerie Thoracique

SpO2 : Saturation Pulsée en oxygène en air ambiant

TDM : Tomodensitométrie

TMPRSS2 : Transmembrane Protéase Serine 2

TSRIM : Technicien supérieur en radiologie et imagerie médicale

TSAR : Technicien supérieur en anesthésie et réanimation

UH : Unité Hounsfield

VD : Ventricule droit

VG : Ventricule gauche

VIH : Virus de l'immunodéficience humaine

VS : Vitesse de sédimentation

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

LISTE DES TABLEAUX

Tableau I : Répartition selon le niveau d'instruction ...35
Tableau II : Répartition des patients en fonction des antécédents	....36
Tableau III : Répartition des patients en fonction des signes fonctionnels	37
Tableau IV : Répartition en fonction des signes généraux	.38
Tableau V : Répartition selon la gravité clinique à l'admission	38
Tableau VI : Bilan biologique	39
Tableau VII : Répartition selon les signes associés aux verres dépolis....	...42
Tableau VIII : Répartition des lésions cardiovasculaires	...44
Tableau IX : Répartition des autres lésions thoraciques observées	47

Tableau X : Particularités des signes généraux des patients admis à la

réanimation 48

Tableau XI : Particularités des antécédents médicaux des patients admis à la

réanimation .48

Tableau XII : Particularités des signes fonctionnels des patients admis à la

réanimation .49

Tableau XIII : Particularités de la gravité clinique à l'admission des patients

admis à a réanimation .50

Tableau XIV : Particularités biologiques des patients admis à la réanimation...50

Tableau XV : Particularités des lésions parenchymateuses en verre dépoli des

patients admis à la réanimation ..51

Tableau XVI : Particularités des lésions parenchymateuses associées des

patients admis à la réanimation ..51

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Tableau XVII : Particularités des lésions cardiovasculaires des patients admis à

la réanimation .52

Tableau XVIII : Association de lésions parenchymateuses et cardiovasculaires

statistiquement non significatives des patients admis à la réanimation.... 53

Tableau XIX : Particularités des signes généraux des patients décédés 53

Tableau XX : Particularités de la gravité clinique à l'admission des patients

décédés 54

Tableau XXI : Particularités des antécédents médicaux des patients décédés 54

Tableau XXII : Particularités des lésions en verre dépoli des patients décédés..55

Tableau XXIII : Particularités des lésions parenchymateuses associées 55

Tableau XXIV : Particularités des lésions cardiovasculaires des patients

décédés 56

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

LISTE DES FIGURES

Figure 1 : Structure des coronavirus 11

Figure 2 : TDM thoracique sans injection, des coupes axiales montrant des

lésions typiques de la pneumopathie à Covid-19 17
Figure 3 : TDM thoracique sans injection, des coupes axiales montrant le signe

de halo 18
Figure 4 : TDM thoracique sans injection, des coupes axiales montrant le signe

de halo inversé 18
Figure 5 : TDM thoracique sans injection, des coupes axiales montrant des

lésions de bronchectasie de traction 19
Figure 6 : TDM thoracique sans injection, des coupes axiales, des différents

degrés d'atteinte de pneumonie Covid-19 ..20 Figure 7 : Patient de 40ans Covid-positif, réalisant un angio-TDM pour
désaturation	.32
Figure 8 : Injecteur automatique de produit de contraste	33
Figure 9 : Flacons de produit de contraste iodé 34
Figure 10 : Diagramme de flux de sélection de la population étudiée.....	36
Figure 11 : Répartition des patients selon les tranches d'âge .	..37
Figure 12 : Répartition des lésions en verre dépoli selon la forme	42
Figure 13 : Répartition des lésions en verre dépoli selon le siège	..43
Figure 14 : Répartition des verres dépolis selon l'étendue	.43

Figure 15 : TDM thoracique en coupe axiale, fenêtre parenchymateuse chez une patiente de 62 ans ayant présenté une désaturation brutale inexpliquée. Hyperdensité parenchymateuse en verre dépoli de forme nodulaire à gauche et

en plage à droite ..44
Figure 16 : TDM thoracique en coupe axiale, fenêtre parenchymateuse chez une patiente de 62 ans ayant présenté une désaturation brutale inexpliquée.

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Hyperdensité parenchymateuse en verre dépoli en plage de siège péribroncho-

vasculaire et sous pleural 45
Figure 17 : TDM thoracique en reconstruction coronale, fenêtre parenchymateuse chez un patient de 65 ans ayant présenté une aggravation respiratoire d'emblée rapide. Hyperdensité parenchymateuse en verre dépoli en

plage de siège mixte 45
Figure 18 : TDM thoracique en reconstruction sagittale, fenêtre parenchymateuse chez une patiente de 62 ans ayant présenté une désaturation brutale inexpliquée. Hyperdensité parenchymateuse en verre dépoli nodulaire et

en plage de siège mixte 46
Figure 19 : Angioscanner thoracique en fenêtre médiastinale chez un homme de 70 ans ayant présenté une douleur thoracique unilatérale. Dilatation des artères

pulmonaires 47
Figure 20 : Angioscanner thoracique en fenêtre médiastinale chez un homme de 70ans ayant présenté une douleur thoracique unilatérale. Hypodensité

endoluminale de l'artère pulmonaire droite 47
Figure 21 : Angioscanner thoracique en fenêtre médiastinale chez un homme de 70 ans ayant présenté une douleur thoracique unilatérale. dilatation des cavités

cardiaques droites 48

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« Par délibération, la faculté a arrêté que les opinions
émises dans les mémoires qui lui sont présentés doivent
être considérés comme propres à leurs auteurs et qu'elle
n'entend leur donner ni approbation, ni improbation »

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INTRODUCTION

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

La maladie à coronavirus 2019 (Covid-19) est causée par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2), un coronavirus qui a été identifié pour la première fois à Wuhan, dans la province du Hubei (en Chine), en décembre 2019. Elle s'est propagée très rapidement et déclarée « urgence de santé internationale » depuis le 30 janvier 2020 [1]. En Afrique, le premier cas de coronavirus est apparu en Egypte le 14 février 2020. Au Togo, le premier cas a été enregistré le 06 mars 2020 et le premier décès le 27 mars 2020. A la date du 05 décembre 2022, on compte 39.332 cas confirmés et 290 décès [2].

Quand la maladie est symptomatique, ses manifestations cliniques sont non spécifiques et comprennent essentiellement la toux et la fièvre associées ou non à la dyspnée, la fatigue, les céphalées, les myalgies, l'agueusie et l'anosmie [3,4]. Les manifestations cliniques de la Covid-19 sont généralement variables chez les enfants que chez les adultes, de même que chez les femmes enceintes et non enceintes [5,6,7,8].

Le diagnostic de certitude de l'infection à Covid-19 consiste en la détection de l'acide ribonucléique (ARN) viral sur écouvillon nasopharyngé par la Reverse Transcription- Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) [9]. Selon la clinique, les patients peuvent bénéficier d'une prise en charge à domicile, en hospitalisation ou en réanimation.

La tomodensitométrie (TDM) thoracique joue un rôle important dans la chaine de prise en charge de ces patients. Elle est utile non seulement au diagnostic radiologique, mais serait à mesure de contribuer au triage des patients [10]. L'apparition des signes de gravité oriente vers l'admission en réanimation des patients sachant que ces derniers ont différents degrés de gravité [11]. Depuis qu'il a été fait état d'une incidence relativement élevée d'embolies pulmonaires, l'angio-TDM joue également un rôle diagnostique

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

décisif [12, 13]. La TDM thoracique peut ainsi être aussi utile pour la prise en charge ultérieure d'une maladie.

Certains malades sont susceptibles de faire une forte réaction inflammatoire environ 7 à 8 jours après le début des symptômes [14]. Aussi, Certains patients hospitalisés présentent une détérioration de leur état, alors que d'autres présentent une évolution plutôt modérée. Cependant, il n'existe pas suffisamment de preuves pour pouvoir décider si, sur la base d'un examen d'imagerie, un patient avec Covid-19 suspecté ou confirmé devrait être hospitalisé [15]. Ainsi, certains éléments de la TDM thoracique sont-ils prédictifs de l'admission d'un patient à la réanimation ou de son hospitalisation ?

Concernant l'évaluation du pronostic, certaines études avaient évalué la mortalité ou l'admission en unité de soins intensifs chez les patients atteints de Covid-19 avec symptômes modérés ou sévères et qui avaient décrit un lien entre l'atteinte pulmonaire et le pronostic [16 - 18].

Au Togo, aucune étude n'a été faite sur l'évaluation du pronostic de la Covid-19 à partir des données d'imagerie thoracique. Nous avons donc décidé de faire une étude sur cette affection dans le but de faire le point sur les éléments prédictifs à la TDM thoracique de la gravité de la Covid-19.

Nos objectifs spécifiques étaient de :

- Décrire les données socio-démographiques

- Décrire les différentes lésions scannographiques observées chez les patients admis à la réanimation et en hospitalisation

- Déterminer les particularités à la TDM thoracique des patients admis à la réanimation et des patients décédés.

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Le plan que nous adopterons après cette introduction est le suivant :

- 1ère partie : généralités

- 2ème partie : cadre et méthode d'étude

- 3ème partie : résultats

- 4ème partie : discussion

Nous finirons par une conclusion et formulerons des suggestions.

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I-GENERALITES

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1. Généralités

1.1 Généralités sur le coronavirus 1.1.1 Description virologique

Définition

Les coronavirus ou « virus en couronne » sont un groupe de virus appartenant à la famille des Coronaviridae, qui infectent à la fois les animaux et les humains. Leur nom provient de l'aspect en « couronne » des spicules formés par une protéine (S) à la surface de l'enveloppe virale. Il s'agit de virus causant des maladies émergentes, c'est-à-dire des infections nouvelles dues à des mutations du virus [19].

v Structure

Les coronavirus sont des virus sphériques enveloppés, de 60 à 220 nm de diamètre. Ils comportent une nucléocapside (NC) hélicoïdale à l'intérieur d'une capside de structure icosaédrique, elle-même entourée d'une enveloppe membranaire [20].

v Enveloppe

L'enveloppe des coronavirus est formée d'au moins quatre protéines structurales: les protéines S (Spike), M et M'(membranaires) et E (enveloppe) (Figure 1) [21].

v Génome

Le génome des coronavirus est une molécule d'ARN linéaire, non segmentée, directement infectieuse. Sa caractéristique principale est sa taille qui est de 27 000 à 31 000 nucléotides. Il s'agit du plus grand ARN viral connu [21].

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v Capside

La capside des coronavirus a une structure icosaédrique comportant une nucléocapside hélicoïdale. La nucléocapside est formée par l'ARN génomique associée à la protéine N. L'emballage de la NC est une partie fondamentale de l'autoassemblage et de la réplication virale. De plus, la protéine N du SARS-CoV-2 affecte les réponses des cellules hôtes et peut jouer un rôle régulateur pendant son cycle de vie virale [21].

v Classification taxonomique

La classification actuelle des coronavirus reconnaît 39 espèces dont 27 sous-genres, cinq genres et deux sous-familles qui appartiennent à la famille de Coronaviridae, sous-ordre des Cornidovirineae, ordre des Nidovirales et règne de Riboviria [22].

Figure 1: Structure des coronavirus [21]

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1.1.2 Transmission

v La transmission interhumaine

La plupart des coronavirus humains sont transmis principalement par voie respiratoire à travers des gouttelettes générées pendant la toux et les éternuements des patients symptomatiques ou par contact avec des sécrétions infectées [23].

Le virus dans le milieu extérieur peut rester viable sur les surfaces pendant des jours dans des conditions atmosphériques favorables. L'infection est acquise par inhalation de ces gouttelettes contaminées, par contact avec la bouche ou les yeux. Les patients peuvent être infectieux aussi longtemps que les symptômes durent et même au rétablissement clinique. Le virus est détruit en moins d'une minute par des désinfectants courants comme l'hypochlorite de sodium et le peroxyde d'hydrogène [24].

v Transmission mère à enfant

Dans une étude menée sur les femmes dans leur troisième trimestre de grossesse qui ont été confirmées comme infectées par le coronavirus, il n'y avait aucune preuve de transmission mère à enfant. Cependant, vu que toutes les femmes enceintes ont subi une césarienne prophylactique, il est difficile de savoir si la transmission peut se produire pendant la naissance par voie vaginale. Notons que la maladie du nouveau-né due à la transmission post-natale a été décrite [25].

v Transmission nosocomiale

La transmission dans un établissement de soin est également une préoccupation importante. La durée d'incubation varie de 2 à 14 jours et la moyenne rapportée est de 5,2 jours [26].

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v Réservoir

La Covid-19 a été provisoirement observée dans un marché de fruits de mer à Wuhan, en Chine, où le contact avec des animaux sauvages peut être à l'origine d'une infection zoonotique. Il a été suggéré qu'il s'agit de l'origine zoonotique probable de la Covid-19 [27]. Il a été également rapporté de l'identification de coronavirus proches du SARS-CoV-2 chez des pangolins malais (Manis javanica) saisis lors d'opérations d'anti-contrebande dans le sud de la Chine [27]. Le génome Pangolin-Cov découvert a montré une identité nucléotidique de 91,02% avec le génome du SARS-CoV-2 [28]. Cependant, la question de savoir si les espèces de pangolins sont de bons candidats pour l'origine du SARS-Cov-2 est toujours en discussion compte tenu de la large diffusion des SARS-CoV dans les réservoirs naturels, tels que les chauves-souris, les chameaux et les pangolins. À ce jour, aucune preuve de réservoirs de coronavirus autres que les mammifères et les oiseaux n'est connue [29].

1.1.3 Physiopathologie de l'infection au SARS-Cov-2 dans ses formes

graves

L'infection au SARS-Cov-2 a des répercussions sur plusieurs appareils de l'organisme qui s'observent le plus souvent dans ses formes graves.

Parmi les manifestations de ces formes graves, l'atteinte pulmonaire avec insuffisance respiratoire est fréquente et peut aller jusqu'à l'insuffisance respiratoire sévère remplissant typiquement les critères de Berlin pour le syndrome de détresse respiratoire aigüe (SDRA) [30]. Le SDRA se définit classiquement comme un oedème pulmonaire généralisé, lésionnel (non cardiogénique), provoquant une hypoxémie, dont la gravité est évaluée par le rapport PO2/FiO2 selon les critères de Berlin de 2012 [31].

Un autre élément spécifique à la pneumonie Covid-19 est l'activation de la coagulation avec la présence de micro et macro-thromboses, notamment pulmonaires, qui pourraient jouer un rôle important dans la pathogénie de

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

l'infection avec en parallèle une véritable maladie endothéliale. Ces évènements thromboemboliques artériels et veineux peuvent concerner jusqu'à 30 % des patients. Des anomalies majeures de la coagulation sont observées avec notamment des concentrations de D-Dimères élevées, des hyperfibrinogénémies et des hyperferritinémies.

La survenue d'une embolie pulmonaire en cours d'évolution vient aggraver l'hypoxémie en perturbant un peu plus les rapports ventilation perfusion et compliquer les conditions de ventilation par la survenue éventuelle d'une hypertension artérielle pulmonaire. De plus, si l'embolie pulmonaire provoque une défaillance ventriculaire droite, l'hypoxémie peut être encore aggravée par la chute du débit cardiaque qui provoque une désaturation du sang veineux en oxygène.

Enfin, une perte de régulation de la vasomotricité pulmonaire semble également être mise en cause. En effet, on observe une discordance entre l'hypoxémie importante, une relative absence de dyspnée, et une compliance pulmonaire préservée (aération pulmonaire conservée), suggérant que l'hypoxémie est le reflet d'une altération de la vasoconstriction hypoxique et de la régulation du débit sanguin pulmonaire, responsables d'une diminution du rapport ventilation/ perfusion [32].

1.2 Clinique

La Covid-19 provoque des manifestation systémiques et pulmonaires [33]. La fièvre, la toux et la dyspnée représentent les signes les plus fréquents ; les autres signes cliniques : les rhinorrhées, les myalgies, l'asthénie, l'expectoration, les douleurs à la gorge, les céphalées, les vertiges et l'hémoptysie [34]. Dans 3-79% des cas, les patients peuvent présenter des symptômes gastro-intestinaux : il s'agit d'anorexie, de diarrhées, de vomissements, de nausées, de douleurs abdominales et de saignement gastro-intestinaux [34]. Les patients peuvent être

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asymptomatique ou présenter des signes digestifs sans présenter des signes pulmonaires [34].

1.3 Formes cliniques

1.3.1 Selon la sévérité : Les patients peuvent être classés en asymptomatiques (absence de symptômes), atteinte moyenne (symptômes modérés sans signe radiologique de pneumonie), pneumonie (présence de symptômes radiographique de pneumonie sans nécessité d'oxygénothérapie), pneumonie sévère (pneumonie avec une des caractéristiques suivante FR> 30cpm, détresse respiratoire sévère ou SpO2 mesurée par oxymétrie pulsée =93% à l'air ambiant ) et pneumonie critique (défaillances respiratoires nécessitant une ventilation mécanique, choc septique ou autre défaillances d'organe ou admission en unité de soins intensif) [35 - 37].

1.3.2 Selon les sujets

· L'enfant : elle est relativement rare ; et est de meilleur pronostic que chez l'adulte [38].

· La femme enceinte et le nouveau-né : plusieurs études ont été réalisées sur la Covid-19 dans ces populations. Dans ces études la majorité de ces patientes étaient au 3eme trimestre de la grossesse et la majorité de leur bébé sont nés par césarienne. Des souffrances foetales, accouchements prématurés, ruptures prématurées des membranes et des petits poids de naissance ont également été observés [38].

· Les patients sous traitement immunosuppresseur

· Les patients avec antécédent de tabagisme : Les études réalisées à ce sujet sont nombreuses, elles ont suggéré que le tabagisme augmente les récepteurs d'ACE au niveau pulmonaire augmentant ainsi la sévérité et la mortalité [38].

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1.4 Paraclinique

1.4.1 La Retro-Transcriptase Polymerase Chain Reaction

La RT-PCR est utilisée pour rechercher l'acide nucléique du virus ; le diagnostic peut être fait par la recherche positive du virus dans des prélèvements de sang, des écouvillons de gorge, des lavage alvéolaires et des prélèvements de crachats [37].

1.4.2 Le scanner thoracique

Après le début des symptômes pulmonaires, le scanner a une sensibilité de 90% et une spécificité de 60% [39].

Le scanner thoracique a pour but de [39] : - Grader la sévérité de l'atteinte

- Faire le diagnostic différentiel - Faire la surveillance

Le scanner thoracique est indiqué chez un patient [39] :

- Testé Covid-19 positif et présentant des signes cliniques pulmonaires

- Ne pouvant pas avoir le résultat de son test rapidement mais présentant des signes cliniques

- Suspect non testé mais avec des comorbidités

Le caractère hautement contagieux de la Covid-19 impose les précautions techniques suivantes [39] :

- Horaire dédiée pour le scanner de patient Covid-19

- Sécuriser le trajet (couloir vide)

- Mettre des vêtements autres que les vêtements de ville, retirer les bijoux et les chaussures fermées.

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

- En salle d'examen : charlotte de protection, masque, lunettes de protection, surblouse manches longues, solution hydroalcoolique, gants recouvrant les manches de la surblouse, surchaussures

- La personne qui installe le patient doit être différente de celle qui est à la console

- Décontamination de la salle immédiatement après l'examen

Les lésions se présentent typiquement comme des opacités en verre dépoli, nodulaire ou en plage, de distribution sous pleurales ou péribronchiques, bilatérales et asymétriques (figure 2).

A un stade avancé, des épaississements septaux inter et intralobulaires peuvent s'ajouter au verre dépoli réalisant l'aspect en crazy paving. A un stade plus évolué sont décrits le signe du Halo (Condensations nodulaires bilatérales entourées de verre dépoli) (figure 3), le signe du halo inversé (Plages nodulaires focales de verre de poli de topographie périphérique, entourés d'un anneau de consolidation alvéolaire au niveau des lobes inférieurs) (figure 4) et des bronchectasies de traction (augmentation localisée et irréversible du calibre des bronches pulmonaire) (figure 5) [39].

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

	AVANT
	DROITE

Figure 2: TDM thoracique sans injection, des coupes axiales montrant des
lésions typiques de la pneumopathie à Covid 19 [40]

DROITE

AVANT

Figure 3 : TDM thoracique sans injection, des coupes axiales montrant le signe

de halo [40]

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

		AVANT
	DROITE

Figure 4 : TDM thoracique sans injection, des coupes axiales montrant le signe
de halo inversé [40]

DROITE

AVANT

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Figure 5 : TDM thoracique sans injection, des coupes axiales montrant des
lésions de bronchectasie de traction [40]

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Trois (3) paramètres permettent d'évaluer la gravité de la pneumopathie à Covid-19 [39] :

- L'étendue des lésions : La société d'imagerie thoracique recommande l'utilisation de la classification visuelle en 5 stades basées sur le pourcentage de poumon lésé (figure 6). Ainsi, on parle de degré d'atteinte :

Ø Absente : si pas de lésion

Ø Minime : inférieure à 10%

Ø Modéré : entre 10 à 25%

Ø Etendu : entre 25 et 50%

Ø Sévère : entre 50 et 75%

Ø Critique : plus de 75%

AVANT DROITE

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Figure 6 : TDM thoracique sans injection, des coupes axiales, des différents degrés d'atteinte de pneumonie Covid-19. L'atteinte pulmonaire, évaluée visuellement comme le ratio du poumon pathologique sur le poumon sain, peut être classée comme minime < 10 % (A), modérée 10-25 % (B), étendue 25-50 % (C), sévère 50-75 % (D) ou critique > 75 % (E) [40].

- Signes de surinfection : une surinfection bactérienne du parenchyme bien que peu fréquente, sera suspectée en cas

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d'apparition d'une condensation alvéolaire unilatérale associée à des adénopathies et/ou des épanchements pleuraux.

- Embolie pulmonaire : la complication la plus redoutable lors de la maladie est l'embolie pulmonaire, en cas de suspicion, un angioscanner thoracique doit être réalisé en urgence.

1.4.3 La biologie

On observe de nombreuses altérations biologiques peu spécifiques [41] :

- Leucopénie, thrombopénie

- Élévation de le CRP

- Elévation de l'ASAT et de l'ALAT

- Elévation de la créatine kinase et de la créatine

- Elévation des D-dimères

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II-MATERIEL ET METHODE

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2.1 Cadre d'étude

Lomé est la capitale du Togo qui s'ouvre sur l'Océan Atlantique au Sud, et où résidaient 1 874 394 habitants en 2021, soit environ le quart de la population du pays [42]. La capitale est subdivisée en deux districts sanitaires, Agoè Nyivé et Golfe, desservis par quatre grands hôpitaux publics : le Centre Hospitalier Universitaire Sylvanus Olympio (CHU SO), le Centre Hospitalier Universitaire Campus (CHU Campus), l'Hôpital de Bè, et le Centre Hospitalier Régional de Lomé Commune (CHR-LC) [42]. Depuis le 21 mars 2020, sur décision du chef de l'Etat Togolais, le CHR-LC a été dédié à la prise en charge des maladies infectieuses dont la Covid-19 [43]. Il est le centre de référence nationale pour la prise en charge des patients atteints de Covid-19 au Togo et nous servira de site d'étude.

2.1.1 Structuration

Le CHR-LC était structuré en différents services :

Ø Service administratif

Il comprenait la direction de l'hôpital avec la division des ressources humaines et celle des finances et de la comptabilité.

Ø Services techniques

Ce département comportait le service des travaux, de lingerie, d'hygiène et d'assainissement, de gardiennage et la morgue.

Ø Service d'imagerie

Ce service disposait de deux tables de radiographie numérique et d'un échographe. Tous les examens de radiographie du thorax et/ou de l'échographie thoracique étaient réalisés sur place dans les salles dédiées ou parfois au lit du malade pour l'échographie. Le scanner n'était pas fonctionnel. Les examens de TDM thoraciques étaient réalisés aussi bien dans les services d'imagerie public que privés à travers une convention avec le CHR-LC.

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Ø Service de laboratoire

Il effectuait les examens de parasitologie, hématologie et biochimie. Certains examens n'étaient pas disponibles et les prélèvements étaient adressés aux laboratoires partenaires comme l'Institut National d'Hygiène, le laboratoire de Centre Hospitalier des Armées de Lomé et le laboratoire de bactériologie du CHU SO.

Ø Services hospitaliers

Ils comprenaient le service des urgences porte, les unités d'hospitalisation conventionnelle, de réanimation, d'hémodialyse, le bloc opératoire et la morgue ayant une capacité théorique de 36 casiers.

Au total, au moment de notre étude, le CHR-LC avait une capacité de 179 lits dont 60 en reanimation et 119 en hospitalisation.

Pour réduire le risque d'infection nosocomiale liée au SARS-CoV-2, le CHR-LC était organisé en trois zones :

La zone rouge (zone contaminée) : C'était une zone considérée comme à haut risque, réservée à la prise en charge des cas confirmés et où l'accès au personnel était conditionné par le port d'équipements de protection individuelle (EPI) comprenant : l'écran facial pour le visage, le chapeau chirurgical jetable, le masque de protection médical type N95, l'uniforme de protection médicale jetable (combinaison complète), les gants en latex jetables, les bottes. Cette zone comprenait les salles de réanimation, les salles d'hospitalisation conventionnelle, l'hémodialyse, et les conteneurs et tentes.

La zone jaune (zone probablement contaminée) : Elle comportait les services d'imagerie médicale, de laboratoire, des urgences porte, le bloc opératoire, de lingerie, et la morgue.

La zone verte : Il s'est agi de la zone réservée à l'administration et de l'espace de vie du personnel qui n'étaient pas en contact direct avec les cas confirmés.

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

2.1.2 Le personnel

Au moment de l'étude, le personnel du CHR-LC comprenait le personnel administratif, technique et de soins.

2.1.2.1 Personnel administratif et technique d'appui

Ø Personnel administratif Il comprenait 8 personnes dont : Le Directeur général du CHR-LC, Le chef personnel,

Le surveillant général,

L'économe,

L'agent comptable,

Trois (03) secrétaires.

Ø Personnel technique d'appui

Il comprenait 16 personnes dont :

Quatre (4) techniciens d'hygiène et assainissement,

Un (1) secretaire medical,

Un (1) technicien biomédical,

Trois (3) agents de lingerie,

Un (1) chef service travaux,

Deux (2) électriciens,

Un (1) plombier,

Un (1) informaticien,

Deux (2) techniciens de la morgue.

2.1.2.2 Personnel de soins

Il était constitué d'une équipe médicale pluridisciplinaire dirigée par deux

professeurs d'université dont un infectiologue et un pneumologue, d'un

personnel paramédical et d'un personnel hospitalier d'appui, répartit comme

suit :

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Personnel médical (exerçant à temps plein et à temps partiel)

Il comprenait 20 personnes dont :

Trois (3) médecins pneumologues,

Deux (2) médecins anesthésistes réanimateurs,

Un (1) médecin urgentiste exerçant comme réanimateur,

Trois (3) médecins interniste,

Deux (2) médecins infectiologues,

Un (1) médecin cardiologue,

Un (1) médecin radiologue

Un (1) médecin néphrologue,

Quatre (4) médecins généralistes,

Un (1) médecin biologiste,

Un (1) pharmacien.

Personnel paramédical

Il comprenait 21 personnes dont:

Un (1) technicien supérieur de santé,

Six (6) techniciens supérieurs d'anesthésiste et de réanimation,

Cinq (5) infirmiers diplômés d'Etat,

Cinq (5) techniciens supérieurs de laboratoire,

Quatre (4) techniciens supérieurs de radiologie et imagerie médicale.

Personnel hospitalier d'appui

Ils comprenaient 20 personnes dont:

Dix (10) garde-malades,

Sept (7) ambulanciers,

Trois (3) serveurs de pharmacie

2.1.3 Organisation du personnel de soins

Il était constitué de 4 équipes composées chacune des différentes catégories de

personnel. Elles fonctionnaient par alternance de permanences (07h30 à 17h30)

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 23

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

et de gardes (17h30 à 07h30). Le reste du personnel assurait uniquement les permanences les jours ouvrables de 07h30 à 17h00.

2.2 Patients et méthodes d'étude

2.2.1 Type et période d'étude

Il s'est agi d'une étude rétrospective, descriptive et analytique portant sur les dossiers cliniques des patients Covid positif ayant séjourné au centre de référence entre le 1^er janvier 2021 et le 31 décembre 2021 soit une durée de douze (12) mois.

2.2.2. Population étudiée

2.2.2.1. Critères d'inclusion

Etaient inclus dans cette étude, tout patient Covid positif ayant été hospitalisé au

CHR-LC et qui a réalisé un examen de TDM thoracique.

2.2.2.2. Critères de non inclusion et d'exclusion

ü Un compte rendu TDM thoracique incomplet pour renseigner la fiche de collecte et les examens de contrôle.

ü Les dossiers cliniques incomplets pour renseigner la fiche de collecte. 2.2.3. Technique de collecte des données

La collecte des données était faite à partir des dossiers cliniques et des comptes rendus de TDM thoraciques. Nous avons établi une fiche de collecte sur la quelle pour chaque patient, nous avons indiqué les données épidémiologique, diagnostique, thérapeutique et pronostique.

2.2.4. Paramètres étudiés

Les différents paramètres étudiés chez chaque patient étaient : l'âge, la profession, les antécédents médicaux, les données cliniques, les aspects à la TDM des atteintes vasculaire, trachéale, parenchymateuse, pleurale, cardiaque et pariétale (confère fiche d'enquête en annexe).

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

2.2.5 Définitions opérationnelles

Un patient covid positif est une personne suspecte de covid avec résultat PCR positif

Covid-19 avec état critique : elle était définie par les critères du syndrome de détresse respiratoire aiguë, un état septique, un choc septique ou d'autres problèmes nécessitant normalement des soins vitaux, comme la mise sous ventilation mécanique (invasive ou non invasive) ou l'administration de vasopresseurs [44].

Forme sévère de la Covid-19 : elle était définie par l'une des catégories suivantes [44] :

- Saturation en oxygène < 90 % en air ambiant.

- Fréquence respiratoire >30 respirations/min pour les adultes et les enfants > 5 ans ; > 60 respirations/min pour les enfants < 2 mois ; > 50 pour les enfants de 2 à 11 mois ; et > 40 pour les enfants de 1 à 5 ans.

- Signes de détresse respiratoire sévère (utilisation des muscles accessoires, incapacité à former une phrase complète et, s'agissant des enfants, tirage costal important, geignement expiratoire, cyanose centrale ou tout autre signe général inquiétant).

Forme modérée de la Covid-19 : elle était définie comme l'absence de tout signe de forme sévère ou critique de la Covid-19 [44].

Forme légère de la Covid-19 : il s'agissait des patients symptomatiques répondant à la définition du cas de Covid-19, exempts de signes de pneumonie virale ni d'hypoxie [44].

Verre dépoli : c'est une hyperdensité du parenchyme pulmonaire n'effaçant pas les contours vasculaires et des parois bronchiques [44]. Elle peut être :

· De forme nodulaire : si elle est arrondie ou ovalaire et de taille variant entre 6mm et 30mm ; en plage si elle est de taille supérieure à 3cm ou de forme mixte si elle est à la fois nodulaire et en plage.

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

· De siège périphérique quand elle est localisée en sous pleural ; péribronchovasculaire quand elle occupe le secteur axial ou mixte si elle occupe à la fois le secteur axial et sous peural.

· D'étendue minime si elle est inférieure à 10% ; modérée si elle située entre 10 et 25% ; étendue si elle est comprise entre 25 et 50% ; sévère si elle est comprise entre 50 et 75% et critique si elle est supérieure à 75%.

Condensation pulmonaire : c'est une augmentation homogène de l'atténuation pulmonaire qui efface les bords des vaisseaux et des parois des voies aériennes. Un bronchogramme aérique peut être présent. Pas de rehaussement après injection du produit de contraste [44].

Dilatation des cavités cardiaques droites : on parle de dilatation des cavités cardiaques droites lorsque le rapport VD/VG mesuré sur des coupes transversales est supérieur à 1[44].

Dilatation des artères pulmonaires : on parle de dilatation des artères pulmonaires lorsque le diamètre du tronc artériel est supérieur à 29mm au niveau de sa bifurcation ou supérieure à l'aorte ascendante et lorsque le rapport diamètre artère pulmonaire/diamètre bronche est supérieur à 1,2 au niveau hilaire [44].

Epaississement septal : on parle d'épaississement septal lorsque les lobules pulmonaires secondaires deviennent très visibles du fait de l'épaississement de leurs parois. Il se traduit par des hyperdensités fines, linéaires et entrecroisées [44].

Collapsus : l'atélectasie ou collapsus est une réduction de volume, de tout ou partie du poumon, accompagnée d'une opacité ou atténuation accrue dans la zone affectée du poumon, avec rehaussement après injection du produit de contraste [44].

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Adénopathie médiastinale : elle est définie comme une augmentation de taille d'un ou de plusieurs ganglions lymphatiques du médiastin, supérieure à 1cm [44].

Embolie pulmonaire : elle est définie par la présence d'une hypodensité endoluminale silhouettée ou non par le produit de contraste et de siège proximal, distal ou mixte [44].

2.2.6 Analyse des données

Les données ont été saisies grâce au logiciel epidata version 3.1. La base ainsi constituée a été analysée avec le logiciel R 4.0.4 dans l'environnement RStudio 1.4. Nous avons procédé à une analyse descriptive univariée et multivariée.

Les variables qualitatives ont été présentées selon leurs effectifs et pourcentages respectifs ; les quantitatives selon leur moyenne +/- écart-type.

v Analyse comparative

Une analyse comparative a été réalisée en vue de rechercher une différence entre les variables recueillies à l'inclusion. Les tests statistiques utilisés étaient le test du Chi-2 de Pearson ou le test exact de Fisher pour les variables qualitatives. Le seuil de significativité a été fixé à 0,05.

v Régression logistique

Une régression logistique univariée et multivariée a été réalisée afin de rechercher les facteurs associés à la gravité. La variable dépendante était l'admission des patients en réanimation codée 1 si oui et 0 si non. Les variables indépendantes étaient : l'étendue des lésions et les lésions cardiovasculaires retrouvées. Les variables statistiquement associées à cette admission en réanimation lors de l'analyse univariée avec un degré de signification p ?0,20 ont été introduites dans le modèle initial. La procédure pas à pas descendante a été utilisée pour la sélection du modèle final. Elle a consisté à inclure toutes les variables choisies dans le modèle initial puis de retirer progressivement les variables les moins significatives. À chaque pas, on vérifiait qu'il n'y avait pas de confusion majeure entre la variable retirée et celles restantes dans le modèle

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

sur la base des modifications de leurs Rapport de côtes (RC) (variation tolérée : 20 %) voire changements radicaux de leurs degrés de significativité. L'analyse multivariée a permis d'estimer le Rapport de côtes ajusté (RCa) et son intervalle de confiance à 95% pour chaque variable retenue. Après l'obtention du modèle final, des interactions ont été recherchées entre les différentes variables du modèle final en incluant des termes d'interaction (produit des 2 variables concernées) dans le modèle et en vérifiant leur non significativité. L'adéquation du modèle a été vérifiée en se basant sur la valeur R².

2.2.7 Ethique

Avant de mener cette étude, nous avons demandé et obtenu l'autorisation de la direction du CHR-LC. Le respect de l'anonymat des dossiers des patients consultés était de rigueur.

2.2.8 Technique de réalisation de la TDM thoracique

Une mission dite « mission scanner » était dédiée à l'organisation et la réalisation de ces examens scannographiques dans les centres d'imagerie partenaires selon un programme bien défini. La coordination était faite par le médecin responsable avec les surveillants des services de scanner.

Composée d'un technicien supérieur en anesthésie et réanimation (TSAR), d'un technicien supérieur en radiologie et imagerie médicale (TSRIM), d'un infirmier diplômé d'état (IDE), d'un hygiéniste (désinfection avant et après réalisation des examens) et d'un ambulancier, l'équipe de la « mission scanner » était chargée d'amener les patients dans les centres partenaires. La liste des patients était saisie et transmise au centre par voie électronique avant l'arrivée des patients. Les clichés étaient imprimés immédiatement et/ou le CD étaient remis à l'équipe de la mission et les résultats d'interprétation du radiologue référent étaient transmis par voie électronique.

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Critères de réalisation : en dehors des patients admis avec une TDM thoracique, l'examen avait été réalisé si on notait une aggravation respiratoire d'emblée rapide, une douleur thoracique avérée unilatérale et/ou tolérance hémodynamique précaire ou une désaturation brutale inexpliquée. Une prise en charge des examens par le comité national était donnée à tous les patients.

Précautions : une attention particulière était portée sur les équipements de protection individuelle du personnel ainsi que sur la décontamination de la salle et des équipements après chaque examen. Le trajet du patient était aussi sécurisé. Une évaluation préalable de la fonction rénale était systématique.

Acquisition sans injection : le topogramme allait de l'orifice cervico-thoracique aux surrénales. On a fait ensuite une acquisition hélicoïdale avec les paramètres de dose qui étaient de 100 à 140 KV pour la tension et une intensité de 120 à 140 milli ampère. Le temps d'exposition était réduit afin d'obtenir la qualité d'image requise et l'épaisseur des coupes était voisine du millimètre. Série injectée : on a injecté 100 à 120 ml de produit de contraste (PDC) en bolus (un débit de 3,5 à 4,5 ml/s) avec un seuil de déclenchement de 100UH et la région d'intérêt (ROI) placée sur le tronc de l'artère pulmonaire ou la veine cave supérieure. L'acquisition était déclenchée automatiquement dès que le seuil est atteint. Les paramètres de dose étaient légèrement abaissés pendant l'acquisition de la série injectée.

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Figure 7 : Patient de 40 ans Covid-19 réalisant Angio-TDM pour désaturation (iconothèque du CHU Campus)

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Figure 8 : injecteur automatique de produit de contraste (iconothèque du
CHU Campus)

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Figure 9 : flacons de produit de contraste iodé (iconothèque du CHU

Campus)

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

III-RESULTATS

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

3.1 Aspects épidémiologiques

3.1.1 Fréquences

Sur les 1176 patients, 298 avaient réalisé une TDM thoracique soit un taux de réalisation du scanner de 25,3%. Deux cent quarante-neuf patients étaient inclus dans l'analyse finale (figure 10). Deux cent-huit patients étaient admis à la réanimation (soit un taux de réanimation de 17,7%) et 41 étaient décédés (soit un taux de décès de 3,4%).

Patients admis au CHR-LC du 1er Janvier 2021 au 31 Décembre 2021 N1=1176					Patients n'ayant pas réalisé de TDM thoracique N2 = 878
Patients ayant réalisé TDM thoracique sur cette période N3=298
			Patients non inclus : - Dossiers incomplets (N4 = 37) - Dossiers non retrouvés (N5=12)
Patients inclus dans l'analyse finale (N6 = 249)

Figure 10 : Diagramme de flux de sélection de la population étudiée

3.1.2 Age

La moyenne d'âge chez les patients positifs au Covid-19 ayant réalisé une TDM thoracique était de 58,02 #177;17,48 ans avec des extrêmes de 20 ans et 95 ans. La tranche d'âge ]40-50] ans était la plus représentée (figure 11).

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

% 25,7%

20,1% 21,3%

18,5%

10,8%

2,8%

0,8%

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= 20 ]20-30] ]30-40] ]40-50] ]50-60] ]60-70] ?70

Tranche d'âge (années)

Figue 11 : Répartition des patients selon les tranches d'âge

3.1.3 Sexe

Il y'avait130 hommes (52,2%) et 119 femmes (47,8%) soit une sex-ratio de 1,1. 3.1.4 Niveau d'instruction

Les personnes ayant un niveau d'instruction universitaire et secondaire étaient les plus représentées avec respectivement 71 cas (28,5%) et 59 cas (23,7 %). (Tableau I).

Tableau I : Répartition selon le niveau d'instruction

Effectif Pourcentage

(n) (%)

Supérieur 71 28,5

Secondaire 59 23,7

Primaire 48 19,3

Non scolarisé 13 5,2

Non renseigné 58 23,3

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

3.2 Aspects cliniques

3.2.1 Antécédents médicaux des patients

Deux cent dix (210) patients (84,3%) avaient au moins un antécédent pathologique connu. L'hypertension artérielle et le diabète étaient retrouvés respectivement chez 120 patients (48,2%) et 88 patients (33,3%) (Tableau II).

Tableau II : Répartition des patients en fonction des antécédents

	Effectif (n)	Pourcentage (%)
HTA	120	48,2
Diabète	88	33,3
Obésité	33	13,2
Infection VIH	9	3,6
Asthme	8	2,4
Drépanocytose	6	2,4

HTA=Hypertension Artérielle VIH= Virus de l'Immunodéficience Humaine

3.2.2 Signes fonctionnels à l'admission

À l'admission, tous les patients étaient symptomatiques. Les signes fonctionnels les plus représentés étaient la toux, la dyspnée et la fièvre retrouvées respectivement dans 61,8% (n=154), 60,2% (n=150) et 48,6% (n=121), on avait noté une douleur thoracique dans 15,6% des cas (Tableau III).

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Tableau III : Répartition des patients en fonction des signes fonctionnels

	Effectif (n)	Pourcentage (%)
Toux	154	61,8
Dyspnée	150	60,2
Fièvre	121	48,6
Asthénie	80	32,1
Céphalées	57	22,9
Douleur thoracique	39	15,6
Arthralgie	22	8,8
Myalgie	21	8,4
Vomissement	11	4,4
Rhinorrhée	11	4,4
Agueusie	9	3,6
Anosmie	8	3,2

3.2.3 Signes généraux à l'admission

Les patients présentaient une polypnée dans 15,3% (n=38), une désaturation dans 43,8% (n=163) et une tachycardie dans 25,7% (n=64) (tableau IV).

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Tableau IV : Répartition en	fonction des signes généraux
	Effectif Pourcentage (n) (%)
FR ? 30	38	15,3
SpO2 ? 92%	163	65,4
Pouls ?100	64	25,7

FR : Fréquence Respiratoire ; SpO2 : Saturation Pulsée en oxygène en air ambiant

3.2.4 Gravité clinique à l'admission

A l'admission, 115 patients (46,2%) étaient des cas sévères. Tandis que 105 patients soit (42, 2%) étaient des cas modérés (Tableau V).

Tableau V : Répartition selon la gravité clinique à l'admission

	Effectif (n)	Pourcentage (%)
Légère	17	6,8
Modérée	105	42,2
Sévère	115	46,2
Critique	12	4,8

3.3 Aspects paracliniques 3.3.1 Bilan biologique

Parmi les 160 patients (53, 7%) qui avaient réalisé la vitesse de sédimentation, 125 patients (92, 3%) avaient une vitesse de sédimentation accélérée. Quant aux D-dimères, 43 patients (14,4%) l'avaient réalisé et 42 patients (97,67%) avaient un taux élevé ; les taux de leucocytes et de lymphocytes avaient été réalisés chez 226 patients (75,8%) (Tableau VI).

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

Tableau VI: Bilan biologique

Effectif Pourcentage

(n) (%)

VS 160

Accélérée 125 78,1

Normale (?20mm) 35 21,9

D-Dimères 43

Élevés 42 97,6

Normaux (?500ug/l) 01 2,4

Taux de Lymphocytes 226

Lymphopénie 42 18,6

Hyperlymphocytose 9 4

Normal (1500-4000/mm³) 175 77,4

Taux de Leucocytes 226

Leucopénie 99 43,8

Hyperleucocytose 16 7,1

Normal (4000-10000/mm³) 111 49,1

VS : vitesse de sédimentation

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

3.3.2 Radiographie thoracique

Sur les 206 patients (69,1%) qui avaient réalisé une radiographie du thorax, 141 (68,4%) l'avaient réalisé à l'admission et 65 (31,5%) l'avaient réalisé avant leur admission. Aucune radiographie n'avait été réalisée au lit du malade. Les examens radiographiques étaient normaux chez 6 patients (3%) et pathologiques chez 200 patients (97%).

3.3.3 Tomodensitométrie thoracique

Deux cent quarante-un patient (96,8%) l'avaient réalisé après leur admission. Huit (3,2%) l'avaient réalisé avant leur admission. Les examens scanographiques étaient normaux chez 9 patients (3,6%) et pathologiques chez 240 patients (96,4%).

Ø Lésions parenchymateuses évocatrices de Covid-19

Sur les 249 examens TDM thoraciques réalisés, 238 (95,6%) ont présenté des lésions en verres dépolis, évocatrices de Covid-19.

- Forme des lésions parenchymateuses en verre dépoli

Trois types de formes avaient été observés avec une prédominance des lésions mixte et en plage (figure 16) dans respectivement 116 cas (48,7%) et 110 cas (46,2%) (figure12).

mixte

49%

nodulaire

5%

plage

46%

Figure 12 : répartition des lésions en verres dépolis selon la forme

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

- Siège des lésions parenchymateuses

Trois types de localisation avaient été notés avec une prédominance des lésions de siège mixte et sous pleural (figures 16, 17 et 18) dans respectivement 186 cas (78,2%) et 33 cas (13,8%) (figure 13).

8%

14%

78%

péribronchique sous pleural mixte

Figure 13 : Répartition des lésions en verres dépolis selon le siège - Etendue des lésions parenchymateuses

L'étendue des lésions était répartie en cinq groupes avec une prédominance des lésions d'étendue sévère et critique dans respectivement 80 cas (33,6%) et 50 cas (21%) (Figure 14).

% 40

35

34%

30

25

20

15%

15

10%

10

5

0

20%

21%

minime modéré etendue sévère critique

Figure 14 : répartition des verres dépolis selon l'étendue

Dr MBAÏAOURE Barak Boukar Mémoire de fin de spécialisation en RIM FSS-UL/2022 40

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

- Autres lésions parenchymateuses associées

Trois types de lésions parenchymateuses étaient associées aux verres dépolis avec une prédominance des épaississements septaux et les troubles ventilatoires dans respectivement 188 cas (88,7%) et 140 cas (66%) (tableau VII).

Tableau VII : répartition selon les signes associés aux verres dépolis

Effectif Pourcentage

(n) (%)

Epaississements septaux 188 88,7

Lésions de collapsus 140 66

Condensation pulmonaire 14 6,6

			AVANT

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Figure 15 : TDM Thoracique en coupe axiale, fenêtre parenchymateuse chez une patiente de 62 ans ayant présenté une désaturation brutale inexpliquée. Hyperdensités parenchymateuses en verre dépoli de forme nodulaire à gauche et en plage à droite [iconothèque du CHR-Lomé commune]

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

			AVANT

Figure 16 : TDM thoracique en coupe axiale, fenêtre parenchymateuse chez une femme de 62 ans ayant présenté une désaturation brutale inexpliquée. Hyperdensité parenchymateuse en verre dépoli en plage de siège péribroncho-vasculaire et sous pleural [iconothèque du CHR-Lomé commune]

			HAUT

Figure 17 : TDM thoracique en reconstruction coronale, fenêtre parenchymateuse chez un Homme de 65 ans ayant présenté une aggravation respiratoire d'emblée rapide. Hyperdensité parenchymateuse en verre dépoli en plage de siège mixte [iconothèque du CHR-Lomé commune]

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

			HAUT

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Figure 18 : TDM Thoracique en reconstruction sagittale, fenêtre parenchymateuse chez une patiente de 62 ans ayant présenté une désaturation brutale inexpliquée. Hyperdensité parenchymateuse en verre dépoli nodulaire et en plage de siège mixte [iconothèque du CHR-Lomé commune]

Ø Lésions cardio-vasculaires

Les principales lésions cardiovasculaires retrouvées étaient une dilatation des artères pulmonaires (figure 19) et des lésions d'embolie pulmonaire (figure 20) dans respectivement 86 cas (34,5%) et 57 cas (22,9%) (tableau VIII).

Tableau VIII : Répartition des lésions cardiovasculaires

	Effectif (n)		Pourcentage (%)	Dilatation artère pulmonaire
86	34,5		Embolie pulmonaire
57	22,9		Dilatation des cavités cardiaques
14	5,6		Epanchement Péricardite
3	1,2

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

			AVANT

Figure 19 : Angioscanner thoracique en fenêtre médiastinale chez un homme de 70 ans ayant présenté une douleur thoracique unilatérale. Dilatation des artères pulmonaires [iconothèque de la polyclinique le coeur]

			AVANT

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Figure 20 : Angioscanner thoracique en fenêtre médiastinale chez un homme de 70 ans ayant présenté une douleur thoracique unilatérale. Hypodensité endoluminale de l'artère pulmonaire droite [iconothèque de la polyclinique le coeur]

Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

	DROITE		AVANT

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Figure 21 : angioscanner Thoracique en fenêtre médiastinale chez un homme de 70 ans ayant présenté une douleur thoracique unilatérale. Dilatation des cavités cardiaques droites [iconothèque de la polyclinique le coeur]

Ø Autres lésions thoraciques observées

En dehors des lésions évocatrices et cardio-vasculaires, d'autres lésions thoraciques avaient été observé avec une prédominance des adénopathies médiastinales, la pleurésie et l'emphysème pulmonaire dans respectivement 7 cas (2,8%) et 6 cas (2,4%) (tableau IX).

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Tableau IX : répartition des autres lésions thoraciques observées

	Effectif (n)		Pourcentage (%)	Adénopathies médiastinales
7	2,8		Pleurésie
6	2,4		Emphysème pulmonaire
6	2,4		Adénopathies axillaires
5	2		Métastases osseuses
4	1,6		Pneumopathies excavées
3	1,2		Epaississement pleural
2	0,8		Pneumo-médiastin
2	0,8		Hydropneumothorax
2	0,8		Tumeur médiastinale
1	0,4

3.4 Particularités des patients admis à la réanimation

1.4.1 Particularités cliniques

Ø Signes généraux à l'admission

Les patients ayant présenté une polypnée supérieure à 30 cycles par minute, une tachycardie supérieure à 100 pulsations par minute et une désaturation inférieure à 92% faisaient plus un séjour à la réanimation qu'en hospitalisation avec une différence statistiquement significative (Tableau X).

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Tableau X : particularités des signes généraux des patients admis à la réanimation

Lieux de séjour hospitalier

Signes généraux	Hospitalisation (41) n(%)	Réanimation (208) n(%)	Total (249) n(%)		P-value
			0,00062		FR ? 30
00(0,0)	38(100)	38(100)			SpO2 ? 92%
04(2,5)	159(97,5)	163(100)			Pouls ?100
05(7,8)	59(92,2)	64(100)

Ø Antécédents médicaux

Les patients hypertendus, diabétiques et obèses faisaient plus un séjour à la réanimation qu'en hospitalisation avec une différence statistiquement significative (Tableau XI).

Tableau XI : particularités des antécédents médicaux des patients admis à la réanimation

Lieu de séjour hospitalier

Antécédents médicaux	Hospitalisation (41) n(%)	Réanimation (208) n(%)	Total (249) n(%)		P-value	HTA
17(14,1)	103(95,9)	120(100)	0,0031		Diabète
10(11,4)	78(88,6)	88(100)	0,031		Obésité
05(15,1)	28(94,5)	33(100)	0,042		Infection VIH
02(22,2)	07(77,8)	09(100)	0,077		Asthme
03(37,5)	05(62,5)	08(100)	0,27		Drépanocytose
02(33,3)	04(66,7)	06(100)	0,083

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Ø Signes fonctionnels

Il n'y avait aucune différence statistiquement significative entre les signes fonctionnels des patients admis aussi bien à la réanimation qu'en hospitalisation. (Tableau XII).

Tableau XII : particularité des signes fonctionnels des patients admis à la réanimation

Lieu de séjour hospitalier

Signes fonctionnels	Hospitalisation (41) n(%)	Réanimation (208) n(%)	Total (249) n(%)		P-value	Toux
21(13,6)	133(86,4)	154(100)	0,067		Dyspnée
11(7,3)	139(92,7)	150(100)	0,074		Fièvre
18(14,9)	103(85,1)	121(100)	0,065		Asthénie
06(7,5)	74(92,5)	80(100)	0,062		Céphalées
09(15,8)	48(84,2)	57(100)	0,094		Douleur thoracique
09(23)	30(77)	39(100)	0,072

Ø Gravité clinique à l'admission

Les patients ayant présenté à l'admission des états cliniques sévère et critique étaient le plus souvent admis à la réanimation avec une différence statistiquement significative (Tableau XIII).

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Tableau XIII : particularité de la gravité clinique à l'admission des patients admis à la réanimation

Gravité clinique		Lieu de séjour hospitalier
	Réanimation (208) n(%)	Total (249) n(%)	P-value		Légère
05(29)	12(71)	17(100)	0,073		Modérée
26(24)	79(76)	105(100)	0,095		Sévère
08(6,9)	107(93,1)	115(100)	0,0063		Critique
00(0)	12(100)	12(100)	0,0001		Total
39(18,7)	210(84,3)	249(100)

3.4.2 Particularités biologiques

Les patients ayant une vitesse de sédimentation accélérée et une leucopénie faisaient plus un séjour à la réanimation qu'en hospitalisation avec une différence statistiquement significative (Tableau XIV).

Tableau XIV : particularités biologiques des patients admis à la

réanimation
	Lieu de séjour hospitalier				Signes biologiques
Hospitalisation (41) n(%)	Réanimation (208) n(%)	Total (249) n(%)	P-value		VS accélérée
13(10,4)	112(89,6)	125(100)	0,0082		D-dimères élevés
07(16,6)	35(83,4)	42(100)	0,064		Lymphopénie
02(4,7)	40(95,3)	42(100)	0,133		Leucopénie
01(1)	98(99)	99(100)	0,001		Hyperleucocytose
06(37,5)	10(62,5)	16(100)	0,059

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3.4.3 Particularités des lésions parenchymateuses pulmonaires en verre dépoli à la TDM

Les patients avec les lésions parenchymateuses pulmonaires d'atteinte critique et sévère étaient le plus souvent admis à la réanimation avec une différence statistiquement significative. (RCa=3,03 ; IC95% [2,72 - 5,43]) pour les atteintes critiques et (RCa = 1,82 ; IC95% [1,42 - 2,75]) pour celles sévères (tableau XV).

Tableau XV : particularités des lésions parenchymateuses en verre dépoli des patients admis à la réanimation

Analyse univariable

Analyse multivariable

Etendue des lésions Réanimation

	n/N	%	RC	IC à 95 P-value	RCa		IC à 95 P-value
			0,0015		0,0061		Critique
48/49	98	3,58	2,17-7,63	3,03	2,72-5,43		Sévère
74/80	92,5	1,89	1,29-3,02	1,82	1,42-2,75		Etendue
41/49	83,7	1,65	1,36-2,59	1,79	1,28-2,96		Modérée
27/37	73	1,22	1,05-2,77	1,38	1,15-2,69		Minime
11/23	47,8	1	-	1	-

RC : Rapport de côtes ; IC : Intervalle de confiance ; RCa : Rapport de côtes ajusté

3.4.4 Particularités des lésions parenchymateuses associées

Il n'y avait aucune différence statistiquement significative entre les lésions parenchymateuses associées des patients admis aussi bien à la réanimation qu'en hospitalisation. (Tableau XVI)

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Tableau XVI : particularités des lésions parenchymateuses associées des patients admis à la réanimation

Lieux de séjour hospitalier

Lésions associées	Hospitalisation (41) n(%)	Réanimation (208) n(%)	Total (249) n(%)		P-value	Condensation pulmonaire
04(28,6)	10(71,4)	14(100)	0,082		Lésions de collapsus
19(13,6)	121(86,4)	140(100)	0,067		Epaississements septaux
22(11,7)	166(88,3)	188(100)	0,82

3.4.5 Particularités des lésions cardiovasculaires

Les patients ayant une dilatation des artères pulmonaires et une embolie pulmonaire étaient le plus souvent admis à la réanimation avec une différence statistiquement significative respective de (RCa=1,52 ; IC95% [1,36 - 2,47]) et (RCa = 1,28 ; IC95% [1,11 - 1,87]) (tableau XVII).

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Tableau XVII : particularités des lésions cardiovasculaires des patients admis à la réanimation

Lésions cardiovasculaires	Analyse univariable Réanimation						Analyse multivariable
	%	RC	IC à 95	P-value	RCa		IC à 95	P-value	Dilatation artères pulmonaires
				0,0356				0,0029	Oui
77/86	89,5	1,66	1,13-2,32		1,52		1,36-2,47		Non
131/163	80,4	1	-		1		-		Embolie pulmonaire
				0,0017				0,007	Oui
51/57	89,5	1,39	1,24-1,92		1,28		1,11-1,87		Non
157/192	81,8	1	-		1		-		Dilatation des cavités cardiaques
				0,063					Oui
13/14	92,9	1,58	0,34-2,45						Non
195/235	83	1	-

RC : Rapport de côtes ; IC : Intervalle de confiance ; RCa : Rapport de côtes ajusté

3.4.6 Particularités de l'association des lésions statistiquement non significatives

Il n'y avait aucune différence statistiquement significative entre l'association des lésions parenchymateuses et cardiovasculaires statistiquement non significatives des patients admis aussi bien à la réanimation qu'en hospitalisation (tableau XVIII).

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Tableau XVIII : association de lésions parenchymateuses et cardiovasculaires statistiquement non significatives des patients admis à la réanimation

Associations		Lieu de séjour hospitalier
	Réanimation (201)	Total (238)	P-value
n(%)	n(%)	n(%)			Etendue + DCC
1(8,3)	11(91,7)	12(100)	0,076		Modérée + DCC
2(40)	3(60)	5(100)	0,069		Minime + DCC
1(25)	3(75)	4(100)	0,199

DCC : Dilatation des cavités cardiaques

3.5 Particularités des patients décédés 3.5.1 particularités cliniques

Ø Signes généraux

Il n'y avait aucune différence statistiquement significative entre les signes généraux des patients ayant survécus que ceux décédés. (Tableau XIX)

Tableau XIX : particularités des signes généraux des patients décédés

Devenir des patients

Signes généraux	Décédés (41)	Survivants (208)	Total (249)		P-value
n(%)	n(%)	n(%)			FR > 30
14(36,8)	24(63,2)	38(100)	0,082		SpO2 ? 92%
34(20,8)	129(79,2)	163(100)	0,058		Pouls >100
10(15,6)	54(84,4)	64(100)	0,095

FR : Fréquence Respiratoire ; SpO2 : Saturation Pulsée en oxygène en air ambiant

Ø Gravité clinique à l'admission

Les patients présentant à l'admission des états cliniques dits critiques étaient le plus exposés au risque de décès que de survie avec une différence statistiquement significative (Tableau XX).

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Tableau XX : Particularités de la gravité clinique à l'admission des patients décédés

Devenir des patients

Gravité clinique	Décédés (41) n(%)	Survivants (208) n(%)	Total (249) n(%)		P-value	Légère
00(0)	17(100)	17(100)	0,136		Modérée
12(11,4)	93(88,6)	105(100)	0,059		Sévère
24(20,9)	91(79,1)	115(100)	0,062		Critique
07(58,3)	05(41,7)	12(100)	0,0063

Ø Antécédents médicaux

Il n'y avait aucune différence statistiquement significative entre les antécédents médicaux des patients ayant survécus que ceux décédés (Tableau XXI).

Tableau XXI : particularités	des antécédents médicaux
	Devenir des patients
Antécédents médicaux	Décédés (41) n(%)	Survivants (208) n(%)	Total (249) n(%)	P-value
HTA	17(14,2)	103(85,8)	120(100)	0,31
Diabète	11(12,5)	77(87,5)	88(100)	0,41
Obésité	06(18,2)	27(81,8)	33(100)	0,07
Infection VIH	03(33,3)	06(66,7)	09(100)	0,06
Asthme	00(0,0)	08(100)	08(100)	0,76
Drépanocytose	00(0,0)	06(100)	06(100)	0,83

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3.5.2 particularités des lésions parenchymateuses pulmonaires en verre dépoli à la TDM thoracique

Les patients ayant des lésions parenchymateuses pulmonaires dites d'étendue critique étaient les plus exposés au risque de décès que de survie avec une différence statistiquement significative (Tableau XXII).

Tableau XXII : particularités des lésions en verre dépolis des patients décédés

Etendues des lésions	Devenir des patients
	Décédés (41) n(%)	Survivants (208) n(%)	Total (249) n(%)	P-value
Critique	17(34)	33(67)	50(100)	0,0062
Sévère	14(17,5)	66(82,5)	80(100)	0,041
Etendue	08(16,7)	40(83,3)	48(100)	0,07
Modérée	02(5,4)	35(94,6)	37(100)	0,86
Minime	00(0,0)	23(100)	23(100)	0,83

3.5.3 particularités des lésions parenchymateuses pulmonaires associées

Il n'y avait aucune différence statistiquement significative entre les lésions parenchymateuses pulmonaires associées des patients ayant survécus que de ceux décédés (Tableau XXIII).

Tableau XXIII : particularités des lésions parenchymateuses associées

Devenir des patients

Lésions associées	Décédés (41)	Survivants (208)	Total (249)	P-value
	n(%)	n(%)	n(%)
Condensation pulmonaire	03(21,4)	11(78,6)	14(100)	0,064
Lésions de collapsus	23(16,4)	117(83,6)	140(100)	0,055
Epaississements septaux	34(18,1)	154(81,9)	188(100)	0,37

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3.5.4 particularités des lésions cardio-vasculaires

Il n'y avait aucune différence statistiquement significative entre les lésions cardio-vasculaires des patients ayant survécus et de ceux décédés (Tableau XXIV).

Tableau XXIV : particularités des lésions cardio-vasculaires des patients décédés

Devenir des patients

Lésions cardio-vasculaires	Décédés (41) n(%)	Survivants (208) n(%)	Total (249) n(%)	P-value
Dilatation artères pulmonaires Embolie pulmonaire Dilatation cavités cardiaques	25(29,1) 8(14) 4(28,6)	61(70,1) 49(86) 10(71,4)	86(100) 57(100) 14(100)	0,062 0,068 0,055

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IV-DISCUSSIONS

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4. Discussion

4.1 Méthodologie

La principale difficulté de l'étude a été la collecte des données. En effet, le système d'archivage des données cliniques était à l'état embryonnaire rendant le travail lent et laborieux parfois. Aussi, le système d'archivage électronique bien que disponible était également en phase d'essaie donc avec des failles ce qui a occasionné l'exclusion de 49 dossiers cliniques sur les 298 patients ayant réalisé une TDM thoracique pendant la période d'étude.

La principale faiblesse a été l'indisponibilité du scanner sur le site d'hospitalisation. En effet, certains patients nécessitant une TDM thoracique mais dans un état instable ou ne pouvant pas être déplacés hors du site n'ont pas pu bénéficier de cette exploration. Ce qui a certainement agi sur notre échantillon.

Les forces de notre étude étaient sa durée et la taille de l'échantillon assez représentatif sachant que c'est l'unique centre de référence d'hospitalisation des patients Covid positif au Togo. Une autre force de l'étude réside dans la fiabilité des interprétations du radiologue référent totalisant plus de 10 ans d'expérience en imagerie thoracique.

Les résultats obtenus reflètent le travail du CHR-LC dans la prise en charge et surtout l'exploration scanographique de la maladie Covid-19 au Togo.

4.2 Aspects épidémiologiques

4.2.1 Taux de réalisation de la TDM thoracique

Dans notre étude, le taux de réalisation de la TDM thoracique était de 25,3%. Long et al. (Chine) et Enora et al. (France) ont trouvé respectivement des taux de réalisation de 42,6% et 80% [45, 46]. L'expansion rapide du virus, l'indisponibilité des tests PCR et l'augmentation quotidienne du nombre de décès pendant la première vague de la pandémie avaient amené à envisager un diagnostic alternatif autre que la RT-PCR pour une prise en charge rapide et efficace surtout en cas de forte affluence de patients symptomatiques. La TDM

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low-dose qui permet de limiter les doses d'irradiation tout en fournissant des images de qualité a été utilisée comme outil de triage chez les patients suspects et à défaut de trouver des lésions évocatrices de Covid-19, elle pouvait permettre d'identifier d'autres diagnostics différentiels. Ainsi, les demandes de TDM thoraciques ont largement augmenté durant cette période de pandémie à Covid-19 et certains patients pourraient avoir à faire plusieurs TDM sur une courte période. L'autre avantage de la TDM est la courte durée d'acquisition et la disponibilité immédiate des résultats qui facilitent également le tri des patients et diminue ainsi le risque de propagation du virus [47].

Dans notre contexte, il n'y a pas eu de véritable afflux de patients comme ce fut le cas en Occident et en Asie. Le personnel affecté dans le centre n'était pas débordé par le nombre de patients et les capacités d'accueil des malades n'étaient pas dépassées. Il n'y avait donc pas un problème de triage des patients. Les patients avaient été examinés et évalués avant de décider de la réalisation ou non d'une TDM thoracique. Les indications de la TDM dans notre contexte après évaluation étaient une aggravation respiratoire d'emblée rapide, une douleur thoracique avérée unilatérale et/ou une tolérance hémodynamique précaire et une désaturation brutale inexpliquée. Cette méthode nous a permis de respecter le principe ALARA et de respecter les trois (03) grands principes fondamentaux de la radioprotection à savoir la justification, l'optimisation et la limitation de dose. Ceci n'a pas été le cas dans de nombreux pays occidentaux et asiatiques où la TDM avait été utilisé en oubliant ces règles majeures.

Les recommandations internationales quant à l'utilisation de la TDM thoracique sont contradictoires: la Société Américaine de Radiologie s'est prononcée contre une utilisation de la TDM comme outil de diagnostic, du fait de ses performances discutables, et du risque de contamination secondaire lors de l'examen [48]. La Société Française de Radiologie suggère au contraire de réaliser une TDM chez tous les patients Covid-19 suspects ou confirmés

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présentant des symptômes respiratoires et nécessitant une prise en charge hospitalière, dans le but d'évaluer le degré de sévérité de l'atteinte pulmonaire et de disposer d'un examen de référence de départ [48]. Enfin, un consensus d'experts a évalué la pertinence de la TDM thoracique dans diverses situations cliniques, en faisant varier la probabilité pré-test, la sévérité du tableau clinique et la disponibilité de la RT- PCR et de la TDM. Ils concluent que la TDM peut avoir une place dans le diagnostic quand la RT- PCR n'est pas disponible ou peu sensible (risque de faux négatifs), ou lorsque les résultats ne sont pas disponibles et que le diagnostic d'infection à SARS-CoV-2 change la prise en charge. En absence de traitement spécifique, cette dernière situation est probablement rare [48]. Dans tous les cas, il faudra toujours respecter les principes fondamentaux de radioprotection.

4.2.2 Age

La Covid-19 est une maladie infectieuse et la gravité intéresse particulièrement des personnes relativement âgées. Cela pourrait s'expliquer par le fait que le vieillissement en soi est associé à une altération de la réponse immunitaire et à un niveau accru d'inflammation chronique responsable d'un contrôle inefficace de la réplication du SARS-CoV-2 pendant la phase aiguë de l'infection [49]. La fréquence est en nette régression au sein de cette population depuis l'apparition des vaccins et l'observance rigoureuse des mesures barrières. Le pic de fréquence varie selon les pays entre 50 et 80 ans [50]. Les cas graves observés avant 50 ans sont rares (2%). Néanmoins, quelques observations ont été faites avant l'âge de 50 ans chez les patients avec des comorbidités, mais cette gravité ne semble pas exister plus tôt, notamment dans l'enfance. L'âge moyen de nos patients était de 52,02 #177; 17,48 ans avec des extrêmes de 20 ans et 95 ans. La répartition par tranche d'âge montrait une plus grande représentation de celle comprise entre 40 ans et 50 ans dans 25,7% des cas. Par rapport à la littérature, nos patients sont légèrement plus jeunes que ceux des pays d'Amérique et

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d'Europe. Dans les études de Francone et al. (Italie) et Zamoner et al. (Brésil), les moyennes d'âge étaient respectivement de 65 ans et 61 ans [11, 51]. L'espérance de vie élevée, la population vieille dans ces pays et le jeune âge de la population africaine expliqueraient cette différence.

4.2.3 Sexe

Cette étude est en faveur d'une prédominance masculine (52,2%). Cette prédominance masculine a été rapportée par Francone et al. (Italie) et Long et al. (Chine) qui notaient respectivement 64,6% et 55,6% [11, 45].

Nos résultats sont conformes aux données de la littérature. Cela pourrait s'expliquer par trois mécanismes à savoir : l'oestrogène qui serait un facteur protecteur contre l'infection à coronavirus chez les sujets de sexe féminin ; l'expression accrue de l'ACE2 chez les sujets de sexe masculin ; et le gène protéase transmembranaire à Serine 2(TMPRSS2) qui joue le rôle d'activateur de la protéine spike et de facilitateur à l'entrée du virus dans les tissus [52]. En effet, l'expression du gène TMPRSS2 est sous la dépendance totale des récepteurs d'androgènes [50]. De plus, le sexe masculin aurait une prépondérance pour les pathologies cardiovasculaires [53, 54].

4.3 Aspects cliniques

4.3.1 Antécédents médicaux

La présente étude rapporte que 84,3% des patients avaient au moins un antécédent pathologique connu. L'hypertension artérielle et le diabète étaient les antécédents les plus fréquents et représentaient respectivement 48,2%, et 33,3%. Ces résultats sont similaires à ceux de Francone et al. (Italie) et Lassau et al. (France) qui ont rapporté une prédominance de l'hypertension artérielle et du diabète chez les patients Covid-19 [11, 18]. Ceci serait dû à la fragilité des personnes hypertendues et diabétiques. La dipeptidylpeptidase-4 (DPP-4), glycoprotéine membranaire ubiquitaire présente à la surface de nombreuses

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cellules et existant aussi sous forme soluble, est impliquée dans les réponses immunitaires inflammatoires en modifiant la production de plusieurs cytokines. Elle est impliquée dans l'infection des cellules par certains virus dont celui de la Covid-19.

4.3.2 Signes fonctionnels et généraux

A l'admission, les signes fonctionnels les plus représentés étaient la toux, la dyspnée et la fièvre. Nos résultats étaient similaires à ceux de Francone et al. (Italie) et Yuan et al. (Chine) [11, 55].

La fréquence respiratoire supérieure à 30 cycles par minute et la saturation pulsée en air ambiant inférieure à 92% étaient fréquemment retrouvés. Ces résultats sont similaires à ceux de Francone et al. (Italie) [11]. Nos résultats sont donc conformes à ceux de la littérature.

4.4 Aspects paracliniques

4.4.1 Bilan biologique

Dans la présente étude, chez la majorité des patients, la vitesse de sédimentation, et les D-Dimères étaient anormalement élevés contrastant avec une leucopénie notoire. Ce constat a été fait par Francone et al. (Italie) [11]. Ces nombreuses altérations biologiques bien que peu spécifiques reflètent l'ampleur du syndrome inflammatoire systémique présent dans les formes graves de la maladie. On pense que ce dernier entraîne une libération massive des cytokines inflammatoires créant une « tempête de cytokines » responsable de lésions tissulaires aiguës avec l'apparition du SDRA [56]. Les taux élevés de D-dimères reflètent la microthrombose vasculaire dans le contexte de coagulopathie associée à la Covid-19 et, selon plusieurs études, ils sont associés à la gravité de la maladie et au risque de passage en réanimation et de décès.

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4.4.2 Radiographie thoracique

Avec un taux de réalisation de 17,5%, la radiographie thoracique bien que modérément sensible et peu spécifique au diagnostic de la maladie Covid-19 ; pourrait être utilisée comme moyen de débrouillage en raison de sa disponibilité et sa portabilité surtout dans nos milieux au Sud du Sahara limités en ressources. Elle permet en outre, la surveillance évolutive chez les malades de réanimation non transportables, ou pour éliminer un pneumothorax, un OAP etc. Cependant, l'indisponibilité de la radiographie mobile pendant la période d'étude était en défaveur des patients de la réanimation

4.4.3 Tomodensitométrie thoracique

Le scanner thoracique a démontré, dans le contexte Covid-19, un intérêt majeur dans le diagnostic afin d'orienter, au mieux, la prise en charge des patients admis à l'hôpital. La TDM thoracique fait partie intégrante de la prise en charge de la Covid-19 et permet une détection précoce des lésions pulmonaires non visibles à la radiographie standard, avec une sensibilité élevée, contrairement à la spécificité qui reste assez moyenne. L'approche TDM s'étend pour identifier les lésions typiques, leur extension, mais également la présence ou non d'une embolie pulmonaire [57].

4.4.3.1 Technique de réalisation

La TDM thoracique injectée (protocole angioscanner) était l'examen couramment réalisé dans notre milieu contrairement aux autres auteurs qui ont une préférence pour le scanner thoracique. L'expansion rapide du virus, l'indisponibilité des tests PCR et l'augmentation quotidienne du nombre de décès pendant la première vague avaient amenés à envisager l'utilisation de la TDM thoracique dans les pays développés pour faire le triage devant l'afflux massif des cas. Cependant, dans nos contrées peu affectées, l'examen clinique et la radiographie du thorax étaient essentiellement utilisés en première intention et

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secondairement la TDM pour évaluer surtout les atteintes cardiovasculaires puis les lésions parenchymateuses.

4.4.3.2 Lésions en verre dépoli

La présente étude rapporte que les lésions en verre dépoli étaient de l'ordre de 95,6%. La forme mixte (48,7%), les sièges mixte (78,2%) et périphérique (13,8), les étendues sévère (33,6%) et critique (21%) associés à des épaississements septaux étaient les caractéristiques majeures de ces atteintes parenchymateuses en verre dépolis. Ces résultats sont similaires à ceux de Song et al. (Chine), Fang et al. (Chine) et Shi et al. (chine) [58, 59, 60]. Dans la littérature, les anomalies scanographiques les plus caractéristiques de la pneumonie Covid-19 sont des plages de verre dépoli (environ 80 % des cas), multifocales, bilatérales et asymétriques. L'atteinte prédomine classiquement dans les régions périphériques, postérieures et basales [61,62,63]. D'autres signes ont été rapportés comme la présence de fines réticulations, d'épaississement péribronchovasculaire, de dilatations vasculaires péri ou intralésionnelles ou de signes de distorsion parenchymateuse [63,64].

4.4.3.3 Lésions cardiovasculaires

La présente étude rapporte que l'embolie pulmonaire et la dilatation des artères pulmonaires étaient les lésions cardiovasculaires les plus fréquentes et représentaient respectivement 23%, et 34,5%. Ces résultats sont similaires à ceux de Asma et al. (Tunisie) et Touahri et al. (Algérie) qui ont rapporté respectivement 11,5% et 25,6% d'embolie pulmonaire [65, 67]. Dans la littérature, l'embolie pulmonaire associée aux pneumonies Covid-19 est en lien avec l'orage inflammatoire qui caractérise les formes graves. Une élévation importante des D-dimères secondaire à la microthrombose vasculaire est un facteur de risque déjà établi [66, 68]. Au Togo, la prévalence hospitalière de l'embolie pulmonaire avant la pandémie à Covid-19 était de 3,1% [69].

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4.5 Facteurs cliniques et biologiques de gravité

Dans cette étude, l'hypertension artérielle, le diabète, la gravité clinique à l'admission, l'hyperleucocytose et la vitesse de sédimentation accélérée étaient corrélées de façon statistiquement significative à l'admission en soins intensifs. Dans la littérature, de nombreux facteurs d'aggravation ont été décrits à plusieurs reprises au cours de la Covid-19 et sont de simples variables cliniques ou biologiques tels que l'âge, l'obésité, les comorbidités, l'infection sévère et critique, l'hypoxémie, le besoin d'oxygène [51, 70]. Nos résultats sont donc conformes à la littérature.

4.6 Facteurs scanographiques de gravité

Dans cette étude, les lésions parenchymateuses dites d'atteinte critique et sévère, l'embolie pulmonaire et la dilatation des artères pulmonaires étaient corrélées de façon statistiquement significative à l'admission des patients en soins intensifs. Nos résultats sont similaires à ceux de Zhao et al.(Chine) [64] qui ont trouvé qu'en dehors des extensions parenchymateuses, des atteintes cardiovasculaires pouvaient conditionner le pronostic fonctionnel des patients. Pour Francone et al. (Italie) [11], seules les atteintes critique et sévère étaient prédictives de l'aggravation de l'état clinique des patients. Cet état de fait pourrait s'expliquer par la non utilisation de l'angioscanner dans sa série. De nombreuses études rapportent une corrélation entre l'extension des lésions et la sévérité clinique. Le principal signe scanographique de gravité est l'étendue des anomalies parenchymateuses sur le scanner initial. C'est à juste titre que la Société d'imagerie thoracique (SIT) recommande de grader l'atteinte parenchymateuse selon une classification visuelle en 5 stades, basée sur le pourcentage de poumon lésé. Parallèlement à l'extension lésionnelle, bien qu'il n'y ait pas encore de grande série publiée, il semblerait que l'embolie pulmonaire soit fréquemment associée aux formes graves de la Covid-19, en lien avec l'orage inflammatoire qui les caractérise [71].

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4.7 Facteurs cliniques et scanographiques de mortalité

Dans cette étude, les patients présentant à l'admission des états cliniques dits critiques et ceux présentant des lésions parenchymateuses pulmonaires dites d'atteinte critique étaient corrélés de façon statistiquement significative au décès. Dans la littérature, de nombreux facteurs de mortalité ont été décrits à plusieurs reprises au cours de la Covid-19 et sont de simples variables cliniques ou scanographiques tels que l'âge, l'obésité, les comorbidités, l'infection sévère et critique, et l'étendue des atteintes parenchymateuses [51, 70].

Dans la présente étude, le taux de mortalité des patients était de 3,4%. Tandis que Yuan et al. (Chine) avaient retrouvé une mortalité de 37 % [55]. Cette différence serait due à l'expansion rapide du virus dans les pays asiatiques et occidentaux couplée à l'espérance de vie élevée et le vieillissement de la population de ces pays.

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CONCLUSION

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La Covid-19 est un véritable problème de santé public et nous avons réalisé une étude rétrospective à visées descriptive et analytique.

Cliniquement, l'HTA et le diabète étaient les principales comorbidités observées tandis que la toux, la dyspnée et la fièvre étaient les signes fonctionnels prépondérants. Les malades aux statuts cliniques modéré et sévère étaient les plus retrouvés à l'admission.

Sur le plan biologique, l'accélération de la vitesse de sédimentation, la leucopénie et l'augmentation des D-dimères étaient les principaux marqueurs retrouvés.

Un patient sur quatre avait réalisé un examen scanographique, avec un taux d'admission à la réanimation presque équivalent et un taux de décès de moins de quatre patients sur cent.

La TDM thoracique a gardé une importante place dans la caractérisation lésionnelle des différentes atteintes. Ainsi, les verres dépolis étaient les lésions parenchymateuses majoritairement observées et étaient parfois associés à d'autres lésions parenchymateuses non spécifiques. L'embolie pulmonaire et la dilatation des artères pulmonaires étaient les principales répercussions cardiovasculaires observées.

Les lésions parenchymateuses d'atteintes critique et sévère, l'embolie pulmonaire et la dilatation des artères pulmonaires étaient les principaux éléments scanographiques prédictifs de gravité.

Les lésions parenchymateuses pulmonaires d'atteinte critique étaient le principal prédicteur de décès chez les patients.

Une étude multicentrique serait souhaitable pour mieux apprécier les facteurs de gravité de cette maladie.

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SUGGESTIONS

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Au terme de cette étude, nous formulons les suggestions suivantes : Aux autorités administratives du CHR-LC

- Doter le service de radiologie d'un appareil de scanner

- Disposer un appareil de radiographie mobile à la réanimation

- Concrétiser le projet de laboratoire d'analyse médicale

Au personnel soignant

Prévoir l'admission en réanimation des patients avec :

- Une atteinte parenchymateuse critique ou évère

- Une embolie pulmonaire ou une dilatation des artères pulmonaires

À l'endroit des populations

- Consulter tôt devant une dyspnée d'installation rapide, une toux, une fièvre ou une douleur thoracique

- Se faire dépister l'hypertension artérielle et le diabète

- Se faire dépister ou s'isoler immédiatement aux moindres signes cliniques de la covid-19 ou en cas de contact avec une personne infectée ;

- Collaborer avec les autorités administratives et le personnel soignant pour une vaccination effective et des mesures barrières efficaces ;

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Tomodensitométrie thoracique et gravité de la Covid-19 au CHR-LC

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ANNEXES

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FICHE D'ENQUETE

TDM thoracique et de la gravité de la Covid-19 au CHR Lomé Commune

1. Caractéristiques sociodémographiques

Age : ans non précisé

Sexe : M F non précisé

Statut matrimonial : célibataire marié(e) divorcé (e) Veuf (ve) non précisé

Niveau d'étude : non scolarisé primaire secondaire supérieur non précisé

2. Facteurs de risque et antécédents

Diabète HTA Asthme Cancer BPCO Obésité

Drépanocytose : tuberculose VIH (+) aucun

Autres à préciser

3. Signes fonctionnels

Fièvre Céphalées Dyspnée Rhinite Myalgie Arthralgie toux

Anosmie Agueusie Diarrhée Vomissement douleur thoracique

Autres à préciser

4. Signes généraux

Fréquence respiratoire : normale anormale non précisée

Saturation en oxygène %.: normale anormale non précisée

Pouls : normal anormal non précisé

Tension artérielle : normale hypertension hypotension non précisée

IMC : normal surpoids obésité obésité morbide non précisé

Choc septique : oui non non précisé

Choc hypovolémique : oui non non précisé

Cas critique : cas sévère : cas modéré : non précisé

Autres à préciser

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5. Signes physiques

Non non précisé

Oui à préciser

6. Signes biologiques

VS .: normale augmentée non précisé

D-dimères : normal augmentés non précisé

Lymphocytes . : normal diminué augmenté non précisé

Leucocytes : normal augmenté diminué non précisé

PCR : Positif négatif : non précisé

7. Signes radiographiques (Rx)

Salle os poumon Rx mobile non précisé

Non non précisé

Oui à préciser

8. Signes de la TDM Thoracique Lieu de réalisation de la TDM :

TDM réalisée avant admission TDM réalisée sur place après admission

TDM réalisée à l'extérieur de l'hôpital après admission non précisé
Qualité de l'injection :

Suffisante non suffisante non précisée

Trachée : Déviée trajet normal non précisé

Bronche droite : Déviée trajet normal non précisé

Bronche gauche : Déviée trajet normal non précisé
Artères pulmonaires :

Calibre normal calibre dilaté non précisé

Hypodensité endoluminale : oui non non précisée

Autres vaisseaux : normal non précisé

Anormal

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Parenchyme :

Lésions en verre dépoli : oui non non précisées

Si oui forme : nodulaire en plage mixte non précisé

Siège : sous pleural péribronchique mixte non précisé

Signes associés : oui non

Épaississement septal lésions de collapsus

Comblement alvéolaire : autres
Etendue de l'atteinte parenchymateuse : non précisée

Minime modérée étendue sévère critique %

Autres lésions : non oui

A préciser

Cavités cardiaques :

Cavités droites : dilatées non dilatées non précisé

Cavités gauches : dilatées non dilatées non précisé

Péricardite : oui non non précisé

Pleurésie : oui non non précisé

Autres foyers pulmonaires organisées : oui non non précisé

si oui préciser :

Adénopathies médiastinales : oui non non précisé

Adénopathies axillaires : oui non non précisé
Paroi osseuse thoracique :

Normale anormale non précisé

Si anormale préciser

Paroi thoracique non osseuse:

Normale anormale non précisé

Si anormale préciser
Glandes surrénales :

Normales anormales non précisé

Si anomalies, préciser :

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9. Lieu d'admission et évolution

Lieu précisé : oui non durée totale de séjours : .jours

Hospitalisation oui non durée jours non précisée

Réanimation oui non durée ..jours non précisée

Complications : oui non préciser

Décédé survivant non précisé

10. Prise en charge thérapeutique

Non précisée : précisée :
Si précisée :

- Respect des mesures générales d'hygiène : oui non

- Oxygénation conventionnelle (choix multiple) : oui non

Si oui préciser : Nasale Masque Masque à haute concentration

- Ventilation mécanique : oui non

Si oui, préciser (choix multiple) : VNI Intubation + ventilation

- Sonde nasogastrique : oui non

- Aspiration bronchique : oui non
- Traitements nébulisés : non

Oui .

- Réanimation cardio-pulmonaire : oui non

- Prophylaxie anti-thromboembolie : oui non

- Traitement anti thrombotique : oui non
- Traitement antiviral : non

Oui

- Corticothérapie : oui non

- Antibiothérapie : oui non
- Autres traitements : non

Oui

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Résumé

Objectif : le but de notre étude était de déterminer les prédicteurs à la TDM thoracique de la gravité de la Covid-19.

Méthodologie : Il s'est agi d'une étude rétrospective descriptive et analytique portant sur les dossiers cliniques des patients Covid positif ayant séjourné au centre de référence entre le 1^er janvier 2021 et le 31 décembre 2021 soit une durée de douze (12) mois.

Résultats : les taux de réalisation du scanner thoracique, de réanimation et de décès étaient respectivement de 25,3%, 17,7% et 3,4%. L'âge moyen des patients était de 58 ans. Il y'avait 130 hommes et 119 femmes. L'hypertension artérielle (48,2%), le diabète (33,3%) et l'obésité (13,2%) étaient les principales comorbidités tandis que la toux (61,8%), la dyspnée (60,2%) et la fièvre (48,6%) étaient les signes fonctionnels les plus représentés à l'admission. Il y avait 95,6% de lésions en verres dépolis, évocatrices de Covid-19. Les verres dépolis de forme mixte (49%) et en plage (46%), de siège mixte (78,2%) et sous pleural (13,8%), d'étendue sévère (33,6%) et critique (21%) étaient prédominants. La dilatation des artères pulmonaires (34,5%) et l'embolie pulmonaire (22,9%) étaient les lésions cardiovasculaires majeures. Les lésions parenchymateuses d'atteinte dite critique et sévère, l'embolie pulmonaire et la dilatation des artères pulmonaires étaient les principaux facteurs scanographiques de gravité.

Conclusion : la TDM thoracique est hautement utilisée dans la prise en charge des malades Covid-19 dans nos milieux comparativement au nombre de patients à la réanimation avec un taux faible de décès. Toutefois, elle peut être utile dans la prévision du devenir hospitalier des patients et par ricochet orienter leur prise en charge future.

Mots clés : Covid-19 grave, TDM thoracique, réanimation, Lomé.

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Summary

Purpose : The aim of our study was to determine the predictors of the severity of Covid-19 disease on thoracic CT.

Methodology : This was a retrospective descriptive and analytical study of the clinical records of Covid-positive patients who stayed at the reference center between January 1st, 2021 and December 31st, 2021, or a period of twelve (12) months.

Results : The rates of chest CT scan, resuscitation and death were 25.3%, 17.7% and 3.4%, respectively. The mean age of the patients was 58 years. There were 130 men and 119 women. Arterial hypertension (48.2%), diabetes (33.3%) and obesity (13.2%) were the main comorbidities while cough (61.8%), dyspnea (60.2%) and fever (48.6%) were the most represented functional signs at admission. There were 95.6% frosted glass lesions, suggestive of Covid-19. Frosted glass of mixed (49%) and beach shape (46%), of mixed (78.2%) and sub pleural (13.8%) location, of severe (33.6%) and critical (21%) extent were predominant. Dilatation of the pulmonary arteries (34.5%) and pulmonary embolism (22.9%) were the major cardiovascular lesions. Parenchymal lesions of so-called critical and severe involvement, pulmonary embolism and dilatation of the pulmonary arteries were the main scanographic factors of gravity.

Conclusion : thoracic CTscan is highly used in the management of Covid-19 patients in our settings compared to the number of patients in the ICU with a low death rate. However, it can be useful in predicting the hospital fate of patients and, in turn, guiding their future care.

Key words : Covid-19 severe, thoracic CT, resuscitation, Lomé.

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