CHAPITRE 1 : SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE
1-Les entérobactéries 3
1-1-Définition 3
1-2-Classification 3
1-3-Caractères bactériologiques 3
1-4-Caractères biochimiques 4
1-5-Caractères antigéniques 4
1-6-Pouvoir Pathogène 4
2-Les f3-lactamines 7
2-1-Classification des f3-lactamines 7
2-1-1-Les pénicillines (noyau péname) 8
2-1-2-Les céphalosporines (noyau céphème)
8
2-1-3-Les pénèmes (Carbapénèmes)
10
2-1-4-Les monobactames 10
2-1-5-Les inhibiteurs des f3-lactamases 10
2-2-Mode d'action des f3-lactamines 12
3-Résistance des entérobactéries aux
f3-lactamines 12
3-1-Types de résistance 12
3-1-1-La résistance naturelle 13
3-1-2-La résistance acquise 13
3-2-Supports génétiques de la résistance
14
3-2-1-Le chromosome 14
3-2-2-Les éléments génétiques
mobiles 14
a) Plasmides 15
b) Séquences d'insertion et transposons 16
c) Les intégrons 16
3-3-Mécanismes de résistance aux f3-lactamines
17
3-3-1-Diminution de la perméabilité 17
3-3-2-Modification de la cible 17
3-3-3-Hyperproduction du système d'efflux 17
3-3-4-Production d'enzymes 18
4-Les f3-lactamases 18
4-1-Classification des f3-lactamases 19
4-1-1-Classification d'Ambler 19
4-1-2-Classification de Bush-Jacoby-Medeiros 20
5-Les f3-lactamases à spectre élargi BLSE 22
5-1-Différents types de BLSE 22
5-1-1-BLSE de type TEM (Temoneira - nom du patient) 22
5-1-2-BLSE de type SHV : (Sulfhydryl variable) 24
5-1-3-BLSE de type CTX-M (Cefotaximase-Munich) 25
5-1-4-Autres types de BLSE 25
5-1-5-Les Carbapénèmases 26
a)Classification des carbapénèmases 26
6-Epidémiologie mondiale des
entérobactéries BLSE 29
6-1-Les BLSE classiques 29
6-1-1-En Europe 29
6-1-2-En Afrique 29
6-1-3-En Asie 30
6-1-4-En Amérique 31
6-2-Les BLSE de type carbapénèmases 32
7-Facteurs de risque d'acquérir une BLSE 33
CHAPITRE 2 : MATERIEL ET METHODES
1-Prélèvement et identification 34
1-1-La mini galerie (galerie classique) 34
1-2-La galerie Api 20E 35
1-3-Le systeme MicroScan WalkAways SIEMENS 35
2-Antibiogramme 36
3-Détection phénotypique des EBLSE 37
3-1-Test de synergie 38
3-2-Test du double disque 38
3-3-Test à la cloxacilline 39
4-Détection génotypique des EBLSE 40
4-1-Extraction d'ADN plasmidique par la lyse alcaline 40
a) Extraction d'ADN 40
b) Extraction de l'ADN chromosomique par Boiling 41
4-2-Amplification par PCR (Polymerase Chain Reaction) 41
4-2-1-Principe 41
4-3-Electrophorèse sur gel d'agarose 43
CHAPITRE 3 : RESULTATS ET DISCUSSION
Résultats 44
1-Entérobactéries 44
1-1-Répartition des entérobactéries par
espèces 44
1-2-Répartition des entérobactéries selon
l'origine de l'infection 45
1-3-Pourcentage des entérobactéries selon le
sexe 45
1-4-Répartition des entérobactéries selon
les tranches d'âge 46
1-5-Profil de résistance des
entérobactéries aux antibiotiques 47
1-6-Profil de résistance des
entérobactéries aux antibiotiques par année 47
a) Résistance aux f3-lactamines 47
b) Résistance aux autres antibiotiques 48
2-Les EBLSE 49
2-1-Fréquence d'isolement des EBLSE 49
2-2-Répartition des EBLSE selon l'espèce 50
2-3-Répartition des EBLSE selon l'origine de
l'infection 50
2-4-Répartition des EBLSE selon le service 51
2-5-Répartition des EBLSE selon la nature du
prélèvement 52
2-6-Répartition des EBLSE selon le sexe 52
2-7-Profil de résistance des EBLSE 53
2-7-1-Résistance aux f3-lactamines 53
2-7-2-Résistance aux aminosides 54
2-7-3-Résistance aux quinolones 54
2-7-4-Résistance aux autres antibiotiques 54
3-Support génétique de la résistance
55
4-Caractérisation des BLSE par la PCR-multiplex 58
4-1-BLSE de type CTX-M 58
4-2-BLSE de type SHV 60
4-3-BLSE de type TEM 60
4-4-Résistances multiples 60
Discussion 63
Conclusions et Perspectives 69
Références bibliographique
72
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